More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1714 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1750  integrase catalytic subunit  70.78 
 
 		 462 aa  685    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3050  integrase catalytic subunit  67.45 
 
 		 512 aa  737    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.985644 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5758  integrase catalytic region  66.67 
 
 		 512 aa  712    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2672  integrase catalytic region  62.57 
 
 		 512 aa  674    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0339  integrase catalytic subunit  70.02 
 
 		 515 aa  763    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5143  integrase catalytic subunit  68.62 
 
 		 512 aa  751    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.1652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1714  putative transposase  100 
 
 		 513 aa  1055    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0806  putative transposase IS3/IS911  79.92 
 
 		 548 aa  835    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2991  integrase catalytic subunit  62.57 
 
 		 512 aa  674    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4798  integrase catalytic region  65.04 
 
 		 512 aa  694    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285753  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5652  integrase catalytic region  66.67 
 
 		 512 aa  712    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1110  integrase catalytic region  64.86 
 
 		 512 aa  697    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3440  integrase catalytic region  65.74 
 
 		 533 aa  707    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.257291 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4442  integrase catalytic region  66.67 
 
 		 512 aa  711    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1303  integrase catalytic subunit  56.92 
 
 		 510 aa  605  9.999999999999999e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1529  integrase catalytic subunit  58.72 
 
 		 505 aa  604  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.544255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1532  integrase catalytic subunit  58.72 
 
 		 505 aa  604  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0156  transposase InsG for insertion sequence IS1353  54.7 
 
 		 514 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0181  Integrase catalytic region  66.84 
 
 		 385 aa  551  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0997  transposase  42.13 
 
 		 522 aa  399  9.999999999999999e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0170218  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2708  transposase IS3/IS911  64.06 
 
 		 288 aa  355  1e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710793  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7482  integrase catalytic region  81.71 
 
 		 191 aa  300  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1807  transposase  39.68 
 
 		 427 aa  294  3e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.411969  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0029  transposase  52.81 
 
 		 258 aa  227  3e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.204737  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03230  transposase  53.81 
 
 		 209 aa  228  3e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.330594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  41.52 
 
 		 283 aa  226  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.274968 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  41.16 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  41.16 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  41.16 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  41.16 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  41.16 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  41.16 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  41.16 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  41.16 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5561  integrase catalytic region  43.53 
 
 		 278 aa  224  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.319693 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  41.16 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  41.16 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0288  integrase catalytic region  43.53 
 
 		 278 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.010827  normal  0.364185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1339  integrase catalytic region  43.53 
 
 		 278 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327623 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3939  integrase catalytic region  43.53 
 
 		 278 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997818  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  41.16 
 
 		 283 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  41.7 
 
 		 279 aa  219  7e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  41.7 
 
 		 279 aa  219  7e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  41.7 
 
 		 279 aa  219  7e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  41.7 
 
 		 279 aa  219  7e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  41.79 
 
 		 267 aa  217  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  41.79 
 
 		 267 aa  217  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  42.75 
 
 		 278 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0273  integrase catalytic subunit  41.07 
 
 		 278 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0592  integrase catalytic subunit  41.07 
 
 		 278 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398355  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1176  integrase catalytic subunit  41.07 
 
 		 278 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.155999  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4616  integrase catalytic subunit  41.07 
 
 		 278 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.698457  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4680  integrase catalytic subunit  41.07 
 
 		 278 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  42.75 
 
 		 278 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  42.29 
 
 		 278 aa  216  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6205  integrase catalytic subunit  43.41 
 
 		 260 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1714  transposase  42.7 
 
 		 278 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5018  ISPsy9, transposase OrfB  40.71 
 
 		 278 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0814  integrase catalytic subunit  43.36 
 
 		 278 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1446  integrase catalytic subunit  43.36 
 
 		 278 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2564  integrase catalytic subunit  43.36 
 
 		 278 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2714  integrase catalytic subunit  43.36 
 
 		 278 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  41.67 
 
 		 278 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  41.67 
 
 		 278 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0298  integrase catalytic subunit  41.42 
 
 		 270 aa  211  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1432  integrase catalytic subunit  41.42 
 
 		 270 aa  211  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  41.3 
 
 		 278 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1197  IS3-family transposase, OrfB  43.09 
 
 		 249 aa  207  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0109  IS3-family transposase, OrfB  43.09 
 
 		 249 aa  207  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0514465  hitchhiker  0.00000245789 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  40.22 
 
 		 278 aa  206  6e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  41.95 
 
 		 269 aa  206  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  37.12 
 
 		 270 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  37.12 
 
 		 270 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  37.12 
 
 		 270 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1068  IS861, transposase OrfB  39.33 
 
 		 277 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0006  IS3 family transposase  37.64 
 
 		 261 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149374 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1788  IS3 family transposase  37.64 
 
 		 261 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0124  ISPsy8, transposase OrfB  41.09 
 
 		 259 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0450  ISPsy8, transposase OrfB  41.09 
 
 		 259 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0516  ISPsy8, transposase OrfB  41.09 
 
 		 259 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5509  ISPsy8, transposase OrfB  41.09 
 
 		 259 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359281  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1459  IS3 family transposase  37.64 
 
 		 261 aa  202  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000914872  normal  0.0630219 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5066  ISPsy8, transposase OrfB  41.09 
 
 		 259 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1332  transposase  37.98 
 
 		 349 aa  201  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00448143  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 		 268 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 		 268 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0729  Integrase catalytic region  42.81 
 
 		 544 aa  200  3.9999999999999996e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1527  IS861, transposase OrfB  38.95 
 
 		 277 aa  200  5e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  41.29 
 
 		 268 aa  200  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  41.29 
 
 		 268 aa  200  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0026  transposase  38.01 
 
 		 269 aa  200  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1071  Integrase catalytic region  36.64 
 
 		 544 aa  199  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.296403  hitchhiker  0.000000028101 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1091  integrase catalytic subunit  39.76 
 
 		 252 aa  197  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1362  integrase catalytic subunit  39.76 
 
 		 252 aa  197  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397787 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1055  integrase catalytic subunit  39.76 
 
 		 252 aa  197  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0509  putative transposase InsK for insertion sequence IS150  47.74 
 
 		 244 aa  197  3e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0218144 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1478  integrase catalytic subunit  39.76 
 
 		 252 aa  197  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.168577  normal  0.117043 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2077  integrase catalytic subunit  36.88 
 
 		 261 aa  196  7e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.74373  normal  0.201044 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2412  integrase catalytic subunit  36.88 
 
 		 261 aa  196  7e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.714231 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2437  integrase catalytic subunit  36.88 
 
 		 261 aa  196  7e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>