64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2708 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2708  transposase IS3/IS911  100 
 
 		 288 aa  588  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710793  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0339  integrase catalytic subunit  83.86 
 
 		 515 aa  477  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0806  putative transposase IS3/IS911  65.37 
 
 		 548 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5143  integrase catalytic subunit  65.96 
 
 		 512 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.1652 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3050  integrase catalytic subunit  64.18 
 
 		 512 aa  359  3e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.985644 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3440  integrase catalytic region  63.48 
 
 		 533 aa  356  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.257291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1714  putative transposase  64.06 
 
 		 513 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5758  integrase catalytic region  62.06 
 
 		 512 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5652  integrase catalytic region  62.06 
 
 		 512 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1110  integrase catalytic region  62.68 
 
 		 512 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4442  integrase catalytic region  61.7 
 
 		 512 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4798  integrase catalytic region  58.51 
 
 		 512 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285753  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1750  integrase catalytic subunit  69.57 
 
 		 462 aa  315  5e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1529  integrase catalytic subunit  53.85 
 
 		 505 aa  280  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.544255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1532  integrase catalytic subunit  53.85 
 
 		 505 aa  280  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2991  integrase catalytic subunit  51.79 
 
 		 512 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2672  integrase catalytic region  51.79 
 
 		 512 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1303  integrase catalytic subunit  51.59 
 
 		 510 aa  268  5e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0156  transposase InsG for insertion sequence IS1353  46.45 
 
 		 514 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0181  Integrase catalytic region  60.39 
 
 		 385 aa  180  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1807  transposase  35.35 
 
 		 427 aa  167  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.411969  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0997  transposase  35.35 
 
 		 522 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0170218  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0012  IS3 family transposase  46.15 
 
 		 172 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.581726  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0029  transposase  44.9 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.204737  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1332  transposase  31.43 
 
 		 349 aa  75.9  0.0000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00448143  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0847  transposase  25.45 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0840  transposase  25.45 
 
 		 228 aa  49.7  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0547  transposase  25.45 
 
 		 228 aa  49.7  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0111  transposase  25.45 
 
 		 228 aa  49.7  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  45.1 
 
 		 278 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  45.1 
 
 		 278 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  36.36 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  36.36 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  36.36 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  36.36 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  36.36 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  36.36 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  36.36 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  36.36 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  36.36 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  36.36 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0453  transposase IS3/IS911 family protein  31.11 
 
 		 104 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00533  hypothetical protein  36.36 
 
 		 191 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.207799  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3669  transposase IS3/IS911 family protein  30.85 
 
 		 101 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0339  transposase IS3/IS911 family protein  31.11 
 
 		 104 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0841  transposase IS3/IS911 family protein  31.11 
 
 		 104 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  36.36 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  36.36 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4971  transposase IS3/IS911 family protein  31.11 
 
 		 104 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4249  transposase IS3/IS911 family protein  31.11 
 
 		 104 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4228  transposase IS3/IS911 family protein  31.11 
 
 		 104 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4160  transposase IS3/IS911 family protein  31.11 
 
 		 104 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3731  transposase IS3/IS911 family protein  31.11 
 
 		 104 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.748336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3600  transposase IS3/IS911 family protein  31.11 
 
 		 104 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3275  transposase IS3/IS911 family protein  31.11 
 
 		 104 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2003  transposase IS3/IS911 family protein  31.11 
 
 		 104 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.523186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1944  transposase IS3/IS911 family protein  31.11 
 
 		 104 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1104  transposase IS3/IS911 family protein  31.11 
 
 		 104 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1031  transposase IS3/IS911 family protein  31.11 
 
 		 104 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0471  transposase IS3/IS911  31.63 
 
 		 104 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  25.96 
 
 		 91 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  25.96 
 
 		 91 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  25.96 
 
 		 91 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1641  transposase IS3/IS911 family protein  29.79 
 
 		 95 aa  43.5  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0492981  normal  0.0662441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>