More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0729 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1071  Integrase catalytic region  99.82 
 
 
544 aa  1069    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.296403  hitchhiker  0.000000028101 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0729  Integrase catalytic region  100 
 
 
544 aa  1071    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0997  transposase  39.1 
 
 
522 aa  240  5.999999999999999e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0170218  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1303  integrase catalytic subunit  36.64 
 
 
510 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1529  integrase catalytic subunit  36.38 
 
 
505 aa  229  9e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.544255  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1532  integrase catalytic subunit  36.38 
 
 
505 aa  229  9e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3050  integrase catalytic subunit  36.12 
 
 
512 aa  216  8e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.985644 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1750  integrase catalytic subunit  34.67 
 
 
462 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0339  integrase catalytic subunit  34.28 
 
 
515 aa  210  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3440  integrase catalytic region  35.65 
 
 
533 aa  205  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.257291 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4442  integrase catalytic region  34.84 
 
 
512 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5652  integrase catalytic region  34.84 
 
 
512 aa  203  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5758  integrase catalytic region  34.84 
 
 
512 aa  203  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4798  integrase catalytic region  41.08 
 
 
512 aa  203  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285753  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0156  transposase InsG for insertion sequence IS1353  32.84 
 
 
514 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1110  integrase catalytic region  40.76 
 
 
512 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2672  integrase catalytic region  33.8 
 
 
512 aa  200  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226674  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2991  integrase catalytic subunit  33.8 
 
 
512 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0181  Integrase catalytic region  32.94 
 
 
385 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5143  integrase catalytic subunit  40.68 
 
 
512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.1652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1714  putative transposase  36.3 
 
 
513 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0806  putative transposase IS3/IS911  34.41 
 
 
548 aa  191  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665244  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03230  transposase  49.07 
 
 
209 aa  176  7e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.330594  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  37.63 
 
 
278 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  37.63 
 
 
278 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  37.86 
 
 
269 aa  160  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  37.28 
 
 
278 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  34.74 
 
 
268 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  34.39 
 
 
268 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  34.74 
 
 
268 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  34.74 
 
 
268 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0124  ISPsy8, transposase OrfB  34.74 
 
 
259 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0450  ISPsy8, transposase OrfB  34.74 
 
 
259 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0516  ISPsy8, transposase OrfB  34.74 
 
 
259 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5509  ISPsy8, transposase OrfB  34.74 
 
 
259 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5066  ISPsy8, transposase OrfB  34.39 
 
 
259 aa  156  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5561  integrase catalytic region  35.77 
 
 
278 aa  154  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.319693 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0026  transposase  34.03 
 
 
269 aa  153  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3939  integrase catalytic region  35.77 
 
 
278 aa  153  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997818  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1339  integrase catalytic region  35.77 
 
 
278 aa  153  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0288  integrase catalytic region  35.77 
 
 
278 aa  153  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.010827  normal  0.364185 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0509  putative transposase InsK for insertion sequence IS150  40.89 
 
 
244 aa  152  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0218144 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  36.4 
 
 
278 aa  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3662  integrase core domain protein  33.33 
 
 
265 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0974  Integrase catalytic region  35.89 
 
 
277 aa  150  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382547  normal  0.109209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3208  Integrase catalytic region  35.89 
 
 
277 aa  150  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.928461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2945  Integrase catalytic region  35.89 
 
 
277 aa  150  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0817746  normal  0.460878 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  34.15 
 
 
279 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  34.15 
 
 
279 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  34.15 
 
 
279 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  34.15 
 
 
279 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0307  transposase orfB, IS150-related  32.99 
 
 
269 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3620  transposase  32.99 
 
 
265 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0498053  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7482  integrase catalytic region  46.88 
 
 
191 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0273  integrase catalytic subunit  34.01 
 
 
278 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0592  integrase catalytic subunit  34.01 
 
 
278 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398355  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1176  integrase catalytic subunit  34.01 
 
 
278 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.155999  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4616  integrase catalytic subunit  34.01 
 
 
278 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.698457  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4680  integrase catalytic subunit  34.01 
 
 
278 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1714  transposase  33.21 
 
 
278 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5018  ISPsy9, transposase OrfB  34.01 
 
 
278 aa  147  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1807  transposase  35.61 
 
 
427 aa  147  6e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.411969  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0194  transposase  33.7 
 
 
253 aa  146  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501333  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  32.41 
 
 
283 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  32.41 
 
 
283 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  32.41 
 
 
283 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  32.41 
 
 
283 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  32.41 
 
 
283 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  32.41 
 
 
283 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  32.41 
 
 
283 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  32.41 
 
 
283 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  32.41 
 
 
283 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  32.41 
 
 
283 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  31.72 
 
 
283 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  31.94 
 
 
270 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  31.94 
 
 
270 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  31.94 
 
 
270 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  32.4 
 
 
283 aa  144  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6205  integrase catalytic subunit  35.06 
 
 
260 aa  143  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346125  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1332  transposase  39.62 
 
 
349 aa  142  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00448143  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  31.25 
 
 
278 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0814  integrase catalytic subunit  34.94 
 
 
278 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1446  integrase catalytic subunit  34.94 
 
 
278 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2564  integrase catalytic subunit  34.94 
 
 
278 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2714  integrase catalytic subunit  34.94 
 
 
278 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  32.98 
 
 
278 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  32.98 
 
 
278 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  31.99 
 
 
267 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1068  IS861, transposase OrfB  30.25 
 
 
277 aa  137  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  31.99 
 
 
267 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1527  IS861, transposase OrfB  29.89 
 
 
277 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0717  integrase catalytic subunit  30.4 
 
 
261 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.558663  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0848  integrase catalytic subunit  30.4 
 
 
261 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1577  integrase catalytic subunit  30.4 
 
 
261 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.279406  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2077  integrase catalytic subunit  30.4 
 
 
261 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.74373  normal  0.201044 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2412  integrase catalytic subunit  30.4 
 
 
261 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.714231 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2437  integrase catalytic subunit  30.4 
 
 
261 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0298  integrase catalytic subunit  31.14 
 
 
270 aa  134  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1432  integrase catalytic subunit  31.14 
 
 
270 aa  134  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2727  integrase catalytic region  32.6 
 
 
248 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74831  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>