More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1332 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1332  transposase  100 
 
 
349 aa  712    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00448143  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1529  integrase catalytic subunit  44.1 
 
 
505 aa  219  6e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.544255  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1532  integrase catalytic subunit  44.1 
 
 
505 aa  219  6e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1110  integrase catalytic region  47.03 
 
 
512 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4442  integrase catalytic region  40.78 
 
 
512 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5758  integrase catalytic region  41.13 
 
 
512 aa  216  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5652  integrase catalytic region  41.13 
 
 
512 aa  216  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1807  transposase  42.68 
 
 
427 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.411969  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0997  transposase  42.68 
 
 
522 aa  212  7.999999999999999e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0170218  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3440  integrase catalytic region  39.78 
 
 
533 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.257291 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0806  putative transposase IS3/IS911  36.88 
 
 
548 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665244  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0156  transposase InsG for insertion sequence IS1353  41.49 
 
 
514 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3050  integrase catalytic subunit  38.16 
 
 
512 aa  200  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.985644 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0181  Integrase catalytic region  37.46 
 
 
385 aa  199  7e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1303  integrase catalytic subunit  36.72 
 
 
510 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4798  integrase catalytic region  37.28 
 
 
512 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285753  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0339  integrase catalytic subunit  36.71 
 
 
515 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0029  transposase  44.68 
 
 
258 aa  189  5.999999999999999e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.204737  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5143  integrase catalytic subunit  36.43 
 
 
512 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.1652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1714  putative transposase  37.63 
 
 
513 aa  186  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1750  integrase catalytic subunit  40.08 
 
 
462 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2991  integrase catalytic subunit  36.75 
 
 
512 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2672  integrase catalytic region  36.75 
 
 
512 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226674  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  40.11 
 
 
278 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  40.11 
 
 
278 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5561  integrase catalytic region  39.04 
 
 
278 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.319693 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  40.64 
 
 
278 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0288  integrase catalytic region  39.04 
 
 
278 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.010827  normal  0.364185 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3939  integrase catalytic region  39.04 
 
 
278 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997818  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1339  integrase catalytic region  39.04 
 
 
278 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327623 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  39.47 
 
 
278 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  39.47 
 
 
278 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  38.95 
 
 
278 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  39.78 
 
 
269 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  35.94 
 
 
283 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  35.94 
 
 
283 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  35.94 
 
 
283 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  35.94 
 
 
283 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  35.94 
 
 
283 aa  139  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  35.94 
 
 
283 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  35.94 
 
 
283 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  35.94 
 
 
283 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  35.94 
 
 
283 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  35.94 
 
 
283 aa  139  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  35.42 
 
 
283 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  35.94 
 
 
283 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1714  transposase  37.43 
 
 
278 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  37.37 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  37.37 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  37.37 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  37.37 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5018  ISPsy9, transposase OrfB  39.56 
 
 
278 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0814  integrase catalytic subunit  36.47 
 
 
278 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1446  integrase catalytic subunit  36.47 
 
 
278 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2564  integrase catalytic subunit  36.47 
 
 
278 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2714  integrase catalytic subunit  36.47 
 
 
278 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6205  integrase catalytic subunit  36.05 
 
 
260 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346125  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0273  integrase catalytic subunit  39.01 
 
 
278 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0592  integrase catalytic subunit  39.01 
 
 
278 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398355  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1176  integrase catalytic subunit  39.01 
 
 
278 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.155999  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4616  integrase catalytic subunit  39.01 
 
 
278 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.698457  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4680  integrase catalytic subunit  39.01 
 
 
278 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1432  integrase catalytic subunit  33.7 
 
 
270 aa  123  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0298  integrase catalytic subunit  33.7 
 
 
270 aa  123  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1091  integrase catalytic subunit  34.39 
 
 
252 aa  122  7e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1478  integrase catalytic subunit  34.39 
 
 
252 aa  122  7e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.168577  normal  0.117043 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1362  integrase catalytic subunit  34.39 
 
 
252 aa  122  7e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0397787 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1055  integrase catalytic subunit  34.39 
 
 
252 aa  122  7e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2397  integrase catalytic region  38.61 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.861552 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4456  integrase catalytic region  38.61 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3346  integrase catalytic region  38.61 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0096806 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3912  integrase catalytic region  38.61 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553017  normal  0.660901 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2938  integrase catalytic region  38.61 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1458  integrase catalytic region  38.61 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31397  normal  0.395934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1740  integrase catalytic region  38.61 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  hitchhiker  0.000236948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2727  integrase catalytic region  38.61 
 
 
248 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74831  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00533  hypothetical protein  34.5 
 
 
191 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.207799  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1071  Integrase catalytic region  39.62 
 
 
544 aa  120  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.296403  hitchhiker  0.000000028101 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0729  Integrase catalytic region  39.62 
 
 
544 aa  120  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  35.91 
 
 
268 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  33.9 
 
 
267 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  33.9 
 
 
267 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  35.91 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  35.91 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  35.36 
 
 
268 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0026  transposase  33.15 
 
 
269 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  33.7 
 
 
270 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  33.7 
 
 
270 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  33.7 
 
 
270 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0509  putative transposase InsK for insertion sequence IS150  46.28 
 
 
244 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0218144 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0124  ISPsy8, transposase OrfB  36.63 
 
 
259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0450  ISPsy8, transposase OrfB  36.63 
 
 
259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0516  ISPsy8, transposase OrfB  36.63 
 
 
259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5066  ISPsy8, transposase OrfB  36.63 
 
 
259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5509  ISPsy8, transposase OrfB  36.63 
 
 
259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359281  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0717  integrase catalytic subunit  33.53 
 
 
261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.558663  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0848  integrase catalytic subunit  33.53 
 
 
261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1577  integrase catalytic subunit  33.53 
 
 
261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.279406  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2077  integrase catalytic subunit  33.53 
 
 
261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.74373  normal  0.201044 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2412  integrase catalytic subunit  33.53 
 
 
261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.714231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>