More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1532 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0339  integrase catalytic subunit  62.14 
 
 
515 aa  651    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1529  integrase catalytic subunit  100 
 
 
505 aa  1043    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.544255  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1532  integrase catalytic subunit  100 
 
 
505 aa  1043    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3050  integrase catalytic subunit  61.43 
 
 
512 aa  645    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.985644 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1303  integrase catalytic subunit  72.16 
 
 
510 aa  769    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4798  integrase catalytic region  61.06 
 
 
512 aa  624  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285753  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5143  integrase catalytic subunit  60.62 
 
 
512 aa  620  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.1652 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1110  integrase catalytic region  59.77 
 
 
512 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5758  integrase catalytic region  58.75 
 
 
512 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5652  integrase catalytic region  58.75 
 
 
512 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3440  integrase catalytic region  59.19 
 
 
533 aa  598  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.257291 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4442  integrase catalytic region  58.56 
 
 
512 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1714  putative transposase  58.72 
 
 
513 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1750  integrase catalytic subunit  62.72 
 
 
462 aa  581  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2672  integrase catalytic region  55.56 
 
 
512 aa  568  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226674  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2991  integrase catalytic subunit  55.56 
 
 
512 aa  568  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0806  putative transposase IS3/IS911  57.23 
 
 
548 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665244  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0156  transposase InsG for insertion sequence IS1353  52.72 
 
 
514 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0181  Integrase catalytic region  61.92 
 
 
385 aa  488  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0997  transposase  44.76 
 
 
522 aa  439  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0170218  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1807  transposase  42.66 
 
 
427 aa  331  2e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.411969  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2708  transposase IS3/IS911  53.85 
 
 
288 aa  280  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710793  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7482  integrase catalytic region  71.34 
 
 
191 aa  259  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  41.37 
 
 
283 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  41.37 
 
 
283 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  41.37 
 
 
283 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  41.37 
 
 
283 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  41.37 
 
 
283 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  41.37 
 
 
283 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  41.37 
 
 
283 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  41.37 
 
 
283 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  41.37 
 
 
283 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  41.37 
 
 
283 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03230  transposase  53.59 
 
 
209 aa  226  7e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.330594  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0029  transposase  52.17 
 
 
258 aa  226  9e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.204737  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  41.37 
 
 
283 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  41.01 
 
 
283 aa  224  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1332  transposase  44.1 
 
 
349 aa  219  1e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00448143  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  41.37 
 
 
278 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  41.37 
 
 
278 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  41.09 
 
 
278 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  41.09 
 
 
278 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0729  Integrase catalytic region  36.5 
 
 
544 aa  214  3.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  40.73 
 
 
278 aa  212  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1071  Integrase catalytic region  36.25 
 
 
544 aa  212  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.296403  hitchhiker  0.000000028101 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0509  putative transposase InsK for insertion sequence IS150  51.46 
 
 
244 aa  211  2e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0218144 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  39.36 
 
 
279 aa  211  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  39.36 
 
 
279 aa  211  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  39.36 
 
 
279 aa  211  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  39.36 
 
 
279 aa  211  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5561  integrase catalytic region  40.29 
 
 
278 aa  210  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.319693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  41.29 
 
 
267 aa  210  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  41.29 
 
 
267 aa  210  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3939  integrase catalytic region  40.29 
 
 
278 aa  210  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997818  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1339  integrase catalytic region  40.29 
 
 
278 aa  210  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0288  integrase catalytic region  40.29 
 
 
278 aa  210  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.010827  normal  0.364185 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  40.98 
 
 
269 aa  209  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0273  integrase catalytic subunit  39.78 
 
 
278 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0592  integrase catalytic subunit  39.78 
 
 
278 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398355  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1176  integrase catalytic subunit  39.78 
 
 
278 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.155999  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4616  integrase catalytic subunit  39.78 
 
 
278 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.698457  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4680  integrase catalytic subunit  39.78 
 
 
278 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  41.57 
 
 
268 aa  206  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0124  ISPsy8, transposase OrfB  40.86 
 
 
259 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0450  ISPsy8, transposase OrfB  40.86 
 
 
259 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0516  ISPsy8, transposase OrfB  40.86 
 
 
259 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5066  ISPsy8, transposase OrfB  40.86 
 
 
259 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5509  ISPsy8, transposase OrfB  40.86 
 
 
259 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359281  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  41.2 
 
 
268 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  41.2 
 
 
268 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  41.2 
 
 
268 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5018  ISPsy9, transposase OrfB  39.78 
 
 
278 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  39.93 
 
 
278 aa  205  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  39.3 
 
 
270 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  39.3 
 
 
270 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  39.3 
 
 
270 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0298  integrase catalytic subunit  38.78 
 
 
270 aa  204  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1432  integrase catalytic subunit  38.78 
 
 
270 aa  204  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1714  transposase  38.13 
 
 
278 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0109  IS3-family transposase, OrfB  42.34 
 
 
249 aa  202  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0514465  hitchhiker  0.00000245789 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1197  IS3-family transposase, OrfB  42.34 
 
 
249 aa  202  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1478  integrase catalytic subunit  39.53 
 
 
252 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.168577  normal  0.117043 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1362  integrase catalytic subunit  39.53 
 
 
252 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0397787 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1055  integrase catalytic subunit  39.53 
 
 
252 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1091  integrase catalytic subunit  39.53 
 
 
252 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0006  IS3 family transposase  39.31 
 
 
261 aa  199  9e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149374 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1068  IS861, transposase OrfB  37.78 
 
 
277 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1459  IS3 family transposase  39.31 
 
 
261 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000914872  normal  0.0630219 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1788  IS3 family transposase  39.31 
 
 
261 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0026  transposase  38.26 
 
 
269 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1527  IS861, transposase OrfB  37.41 
 
 
277 aa  197  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  37.87 
 
 
278 aa  195  1e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0717  integrase catalytic subunit  38.22 
 
 
261 aa  195  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.558663  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0848  integrase catalytic subunit  38.22 
 
 
261 aa  195  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1577  integrase catalytic subunit  38.22 
 
 
261 aa  195  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.279406  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0814  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
278 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1446  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
278 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2564  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
278 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2714  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 
278 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6205  integrase catalytic subunit  38.76 
 
 
260 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346125  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>