More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0806 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009670  Oant_4798  integrase catalytic region  64.61 
 
 
512 aa  649    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285753  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3440  integrase catalytic region  67.4 
 
 
533 aa  702    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.257291 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5758  integrase catalytic region  66.46 
 
 
512 aa  679    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0339  integrase catalytic subunit  71.37 
 
 
515 aa  739    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5143  integrase catalytic subunit  70.37 
 
 
512 aa  718    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.1652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1714  putative transposase  79.92 
 
 
513 aa  814    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0806  putative transposase IS3/IS911  100 
 
 
548 aa  1132    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665244  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1110  integrase catalytic region  65.64 
 
 
512 aa  671    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4442  integrase catalytic region  66.26 
 
 
512 aa  675    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5652  integrase catalytic region  66.46 
 
 
512 aa  679    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1750  integrase catalytic subunit  71.95 
 
 
462 aa  656    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3050  integrase catalytic subunit  70.16 
 
 
512 aa  723    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.985644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2672  integrase catalytic region  61.32 
 
 
512 aa  619  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226674  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2991  integrase catalytic subunit  61.32 
 
 
512 aa  619  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1303  integrase catalytic subunit  57.41 
 
 
510 aa  578  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0156  transposase InsG for insertion sequence IS1353  56.38 
 
 
514 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1529  integrase catalytic subunit  57.23 
 
 
505 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.544255  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1532  integrase catalytic subunit  57.23 
 
 
505 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0181  Integrase catalytic region  65.18 
 
 
385 aa  502  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0997  transposase  42.8 
 
 
522 aa  396  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0170218  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2708  transposase IS3/IS911  65.37 
 
 
288 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.710793  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1807  transposase  40.28 
 
 
427 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.411969  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7482  integrase catalytic region  79.56 
 
 
191 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0029  transposase  49.78 
 
 
258 aa  219  1e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.204737  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1332  transposase  36.88 
 
 
349 aa  204  3e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00448143  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03230  transposase  51.34 
 
 
209 aa  199  9e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.330594  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  41.02 
 
 
283 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.274968 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  41.02 
 
 
283 aa  197  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  41.02 
 
 
283 aa  197  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  41.02 
 
 
283 aa  197  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  41.02 
 
 
283 aa  197  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  41.02 
 
 
283 aa  197  6e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  41.02 
 
 
283 aa  197  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  41.02 
 
 
283 aa  197  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  41.02 
 
 
283 aa  197  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  41.02 
 
 
283 aa  197  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  41.02 
 
 
283 aa  197  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  41.02 
 
 
283 aa  195  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5561  integrase catalytic region  39.29 
 
 
278 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.319693 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1339  integrase catalytic region  39.29 
 
 
278 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0288  integrase catalytic region  39.29 
 
 
278 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.010827  normal  0.364185 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3939  integrase catalytic region  39.29 
 
 
278 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997818  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  40.08 
 
 
278 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  40.08 
 
 
278 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  39.84 
 
 
278 aa  188  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  39.84 
 
 
278 aa  188  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  39.26 
 
 
278 aa  186  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0509  putative transposase InsK for insertion sequence IS150  47.06 
 
 
244 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0218144 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  38.43 
 
 
279 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  38.43 
 
 
279 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  39.45 
 
 
278 aa  184  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  38.21 
 
 
267 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  38.21 
 
 
267 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  38.43 
 
 
279 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  38.43 
 
 
279 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0729  Integrase catalytic region  34.41 
 
 
544 aa  182  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1071  Integrase catalytic region  34.41 
 
 
544 aa  182  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.296403  hitchhiker  0.000000028101 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  40.08 
 
 
269 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1432  integrase catalytic subunit  38.27 
 
 
270 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0298  integrase catalytic subunit  38.27 
 
 
270 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6205  integrase catalytic subunit  39.24 
 
 
260 aa  181  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346125  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0814  integrase catalytic subunit  39.22 
 
 
278 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1446  integrase catalytic subunit  39.22 
 
 
278 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2564  integrase catalytic subunit  39.22 
 
 
278 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2714  integrase catalytic subunit  39.22 
 
 
278 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5018  ISPsy9, transposase OrfB  37.41 
 
 
278 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0273  integrase catalytic subunit  37.41 
 
 
278 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0592  integrase catalytic subunit  37.41 
 
 
278 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398355  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1176  integrase catalytic subunit  37.41 
 
 
278 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.155999  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4616  integrase catalytic subunit  37.41 
 
 
278 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.698457  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4680  integrase catalytic subunit  37.41 
 
 
278 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1714  transposase  37.41 
 
 
278 aa  178  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1197  IS3-family transposase, OrfB  38.6 
 
 
249 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0109  IS3-family transposase, OrfB  38.6 
 
 
249 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0514465  hitchhiker  0.00000245789 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  35.39 
 
 
270 aa  172  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  35.39 
 
 
270 aa  172  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  35.39 
 
 
270 aa  172  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1091  integrase catalytic subunit  37.3 
 
 
252 aa  171  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1055  integrase catalytic subunit  37.3 
 
 
252 aa  171  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1478  integrase catalytic subunit  37.3 
 
 
252 aa  171  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.168577  normal  0.117043 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1362  integrase catalytic subunit  37.3 
 
 
252 aa  171  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0397787 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0026  transposase  35.39 
 
 
269 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  36 
 
 
278 aa  170  5e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  37.8 
 
 
268 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  37.8 
 
 
268 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0717  integrase catalytic subunit  34.45 
 
 
261 aa  169  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.558663  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0848  integrase catalytic subunit  34.45 
 
 
261 aa  169  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1577  integrase catalytic subunit  34.45 
 
 
261 aa  169  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.279406  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2077  integrase catalytic subunit  34.45 
 
 
261 aa  169  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.74373  normal  0.201044 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2412  integrase catalytic subunit  34.45 
 
 
261 aa  169  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.714231 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2437  integrase catalytic subunit  34.45 
 
 
261 aa  169  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  37.4 
 
 
268 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  37.4 
 
 
268 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1068  IS861, transposase OrfB  34.27 
 
 
277 aa  167  4e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1527  IS861, transposase OrfB  33.87 
 
 
277 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0006  IS3 family transposase  34.87 
 
 
261 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149374 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1459  IS3 family transposase  34.87 
 
 
261 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000914872  normal  0.0630219 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1788  IS3 family transposase  34.87 
 
 
261 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3620  transposase  33.76 
 
 
265 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0498053  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3662  integrase core domain protein  34.18 
 
 
265 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>