More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0029 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0029  transposase  100 
 
 
258 aa  525  1e-148  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.204737  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5652  integrase catalytic region  51.14 
 
 
512 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5758  integrase catalytic region  51.14 
 
 
512 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1110  integrase catalytic region  55.41 
 
 
512 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4442  integrase catalytic region  50.76 
 
 
512 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1303  integrase catalytic subunit  52.59 
 
 
510 aa  236  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1750  integrase catalytic subunit  52.16 
 
 
462 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3440  integrase catalytic region  52.59 
 
 
533 aa  230  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.257291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3050  integrase catalytic subunit  48.48 
 
 
512 aa  229  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.985644 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0339  integrase catalytic subunit  50.21 
 
 
515 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5143  integrase catalytic subunit  50.43 
 
 
512 aa  227  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.1652 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1529  integrase catalytic subunit  51.72 
 
 
505 aa  227  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.544255  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1532  integrase catalytic subunit  51.72 
 
 
505 aa  227  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4798  integrase catalytic region  51.09 
 
 
512 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285753  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2672  integrase catalytic region  49.14 
 
 
512 aa  221  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226674  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2991  integrase catalytic subunit  49.14 
 
 
512 aa  221  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0181  Integrase catalytic region  43.77 
 
 
385 aa  221  9e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0806  putative transposase IS3/IS911  49.36 
 
 
548 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665244  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1714  putative transposase  48.86 
 
 
513 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0156  transposase InsG for insertion sequence IS1353  46.61 
 
 
514 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1332  transposase  45 
 
 
349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00448143  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1807  transposase  46.35 
 
 
427 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.411969  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0997  transposase  46.35 
 
 
522 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0170218  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5018  ISPsy9, transposase OrfB  39.34 
 
 
278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  40.98 
 
 
278 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0273  integrase catalytic subunit  39.34 
 
 
278 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0592  integrase catalytic subunit  39.34 
 
 
278 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398355  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1176  integrase catalytic subunit  39.34 
 
 
278 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.155999  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4616  integrase catalytic subunit  39.34 
 
 
278 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.698457  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4680  integrase catalytic subunit  39.34 
 
 
278 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  40.76 
 
 
278 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  40.76 
 
 
278 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1055  integrase catalytic subunit  43.42 
 
 
252 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1091  integrase catalytic subunit  43.42 
 
 
252 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1362  integrase catalytic subunit  43.42 
 
 
252 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0397787 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1478  integrase catalytic subunit  43.42 
 
 
252 aa  137  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.168577  normal  0.117043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  41.24 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  41.24 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0717  integrase catalytic subunit  40.94 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.558663  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0848  integrase catalytic subunit  40.94 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1577  integrase catalytic subunit  40.94 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.279406  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2077  integrase catalytic subunit  40.94 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.74373  normal  0.201044 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2412  integrase catalytic subunit  40.94 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.714231 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2437  integrase catalytic subunit  40.94 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  36.9 
 
 
283 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  36.9 
 
 
283 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  36.9 
 
 
283 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  36.9 
 
 
283 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  36.9 
 
 
283 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  36.9 
 
 
283 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  36.9 
 
 
283 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  36.9 
 
 
283 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  41.24 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  40.68 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  36.9 
 
 
283 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  36.9 
 
 
283 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0124  ISPsy8, transposase OrfB  41.67 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0450  ISPsy8, transposase OrfB  41.67 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0516  ISPsy8, transposase OrfB  41.67 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5066  ISPsy8, transposase OrfB  41.67 
 
 
259 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5509  ISPsy8, transposase OrfB  41.67 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  36.9 
 
 
283 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  36.9 
 
 
283 aa  132  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  40.22 
 
 
278 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  40.22 
 
 
278 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  36.56 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  36.56 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  36.56 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  36.56 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0006  IS3 family transposase  40.12 
 
 
261 aa  130  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149374 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1459  IS3 family transposase  40.12 
 
 
261 aa  130  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000914872  normal  0.0630219 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1788  IS3 family transposase  40.12 
 
 
261 aa  130  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2727  integrase catalytic region  41.45 
 
 
248 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74831  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3912  integrase catalytic region  41.45 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553017  normal  0.660901 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3346  integrase catalytic region  41.45 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0096806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1458  integrase catalytic region  41.45 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31397  normal  0.395934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2938  integrase catalytic region  41.45 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1740  integrase catalytic region  41.45 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  hitchhiker  0.000236948 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4456  integrase catalytic region  41.45 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2397  integrase catalytic region  41.45 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.861552 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1714  transposase  36.61 
 
 
278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  38.8 
 
 
278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2945  Integrase catalytic region  43.62 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0817746  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3208  Integrase catalytic region  43.62 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.928461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0974  Integrase catalytic region  43.62 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382547  normal  0.109209 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0026  transposase  39.6 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  37.29 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  37.29 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  37.29 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6205  integrase catalytic subunit  39.88 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346125  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5561  integrase catalytic region  38.98 
 
 
278 aa  125  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.319693 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3939  integrase catalytic region  38.98 
 
 
278 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997818  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  38.98 
 
 
269 aa  125  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0288  integrase catalytic region  38.98 
 
 
278 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.010827  normal  0.364185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1339  integrase catalytic region  38.98 
 
 
278 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327623 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0814  integrase catalytic subunit  40 
 
 
278 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1446  integrase catalytic subunit  40 
 
 
278 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2564  integrase catalytic subunit  40 
 
 
278 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2714  integrase catalytic subunit  40 
 
 
278 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0748  integrase catalytic subunit  40.62 
 
 
252 aa  123  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.401665  normal  0.472913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>