143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1803 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0997  transposase  100 
 
 		 522 aa  156  7e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0170218  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1803  transposase  100 
 
 		 73 aa  154  4e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0740053  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3050  integrase catalytic subunit  54.05 
 
 		 512 aa  89.4  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.985644 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0181  Integrase catalytic region  54.05 
 
 		 385 aa  88.2  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0339  integrase catalytic subunit  54.05 
 
 		 515 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1529  integrase catalytic subunit  54.05 
 
 		 505 aa  85.5  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.544255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1532  integrase catalytic subunit  54.05 
 
 		 505 aa  85.5  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1750  integrase catalytic subunit  54.05 
 
 		 462 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1303  integrase catalytic subunit  54.05 
 
 		 510 aa  85.1  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2991  integrase catalytic subunit  52.7 
 
 		 512 aa  84.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2672  integrase catalytic region  52.7 
 
 		 512 aa  84.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5143  integrase catalytic subunit  52.7 
 
 		 512 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.1652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1714  putative transposase  54.05 
 
 		 513 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7482  integrase catalytic region  51.35 
 
 		 191 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5652  integrase catalytic region  55.56 
 
 		 512 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5758  integrase catalytic region  55.56 
 
 		 512 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4442  integrase catalytic region  55.56 
 
 		 512 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4798  integrase catalytic region  52.78 
 
 		 512 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285753  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1336  transposase  56.76 
 
 		 74 aa  79.3  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1110  integrase catalytic region  54.17 
 
 		 512 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0729  Integrase catalytic region  61.02 
 
 		 544 aa  77.4  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3440  integrase catalytic region  58.18 
 
 		 533 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.257291 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1071  Integrase catalytic region  59.32 
 
 		 544 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.296403  hitchhiker  0.000000028101 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0033  transposase  51.35 
 
 		 83 aa  75.9  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0156  transposase InsG for insertion sequence IS1353  47.3 
 
 		 514 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03230  transposase  52.7 
 
 		 209 aa  73.6  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.330594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0806  putative transposase IS3/IS911  60.87 
 
 		 548 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  47.83 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  47.83 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0124  ISPsy8, transposase OrfB  50.85 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0450  ISPsy8, transposase OrfB  50.85 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0516  ISPsy8, transposase OrfB  50.85 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5066  ISPsy8, transposase OrfB  50.85 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5509  ISPsy8, transposase OrfB  50.85 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359281  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  47.83 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  47.83 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  47.14 
 
 		 278 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  47.14 
 
 		 278 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0026  transposase  41.1 
 
 		 269 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0273  integrase catalytic subunit  43.48 
 
 		 278 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0592  integrase catalytic subunit  43.48 
 
 		 278 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398355  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1176  integrase catalytic subunit  43.48 
 
 		 278 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.155999  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4616  integrase catalytic subunit  43.48 
 
 		 278 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.698457  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4680  integrase catalytic subunit  43.48 
 
 		 278 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5018  ISPsy9, transposase OrfB  43.48 
 
 		 278 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3208  Integrase catalytic region  44.93 
 
 		 277 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2945  Integrase catalytic region  44.93 
 
 		 277 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0817746  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0974  Integrase catalytic region  44.93 
 
 		 277 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382547  normal  0.109209 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3594  transposase, IS3 family  39.71 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124578 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3343  transposase  39.71 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0307  transposase orfB, IS150-related  39.71 
 
 		 269 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1417  IS861, transposase (orf2), IS3 family, truncated  39.13 
 
 		 212 aa  48.9  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1068  IS861, transposase OrfB  38.03 
 
 		 277 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1527  IS861, transposase OrfB  38.03 
 
 		 277 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3662  integrase core domain protein  39.71 
 
 		 265 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0298  integrase catalytic subunit  42.03 
 
 		 270 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1432  integrase catalytic subunit  42.03 
 
 		 270 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3620  transposase  39.13 
 
 		 265 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0498053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1197  IS3-family transposase, OrfB  39.19 
 
 		 249 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1714  transposase  43.64 
 
 		 278 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0109  IS3-family transposase, OrfB  39.19 
 
 		 249 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0514465  hitchhiker  0.00000245789 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  38.03 
 
 		 278 aa  47.4  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  39.19 
 
 		 267 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  39.19 
 
 		 267 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4086  transposase, C-terminal region  43.64 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1055  integrase catalytic subunit  42.11 
 
 		 252 aa  47  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1091  integrase catalytic subunit  42.11 
 
 		 252 aa  47  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1362  integrase catalytic subunit  42.11 
 
 		 252 aa  47  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397787 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1478  integrase catalytic subunit  42.11 
 
 		 252 aa  47  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.168577  normal  0.117043 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  42.03 
 
 		 278 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0428  transposase  40.74 
 
 		 277 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  40.3 
 
 		 270 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4363  transposase  39.13 
 
 		 215 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267789  hitchhiker  2.99756e-22 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  42.03 
 
 		 278 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  42.03 
 
 		 269 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  42.03 
 
 		 278 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  40.58 
 
 		 278 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  40.3 
 
 		 270 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  40.3 
 
 		 270 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1165  integrase catalytic region  39.13 
 
 		 222 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000468999 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0288  transposase  38.89 
 
 		 277 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0288  integrase catalytic region  39.13 
 
 		 278 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.010827  normal  0.364185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1339  integrase catalytic region  39.13 
 
 		 278 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327623 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3939  integrase catalytic region  39.13 
 
 		 278 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997818  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5561  integrase catalytic region  39.13 
 
 		 278 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.319693 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0194  transposase  41.82 
 
 		 253 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501333  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  37.84 
 
 		 279 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  37.84 
 
 		 279 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  37.84 
 
 		 279 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  37.84 
 
 		 279 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1183  integrase catalytic subunit  38.98 
 
 		 276 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0773839 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15050  transposase  43.4 
 
 		 285 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.316809  normal  0.91579 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0196  integrase core subunit  35.71 
 
 		 261 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0350068 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0908  integrase core subunit  35.71 
 
 		 261 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3122  integrase core subunit  35.71 
 
 		 261 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00391606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3759  integrase core subunit  35.71 
 
 		 261 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3804  integrase core subunit  35.71 
 
 		 261 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3902  integrase core subunit  35.71 
 
 		 261 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3998  integrase core subunit  35.71 
 
 		 261 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4172  integrase core subunit  35.71 
 
 		 261 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421914 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>