297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1336 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1336  transposase  100 
 
 		 74 aa  155  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3050  integrase catalytic subunit  66.22 
 
 		 512 aa  103  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.985644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1714  putative transposase  64.86 
 
 		 513 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1303  integrase catalytic subunit  64.86 
 
 		 510 aa  99.8  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0339  integrase catalytic subunit  62.16 
 
 		 515 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4798  integrase catalytic region  64.38 
 
 		 512 aa  99.4  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285753  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1750  integrase catalytic subunit  63.51 
 
 		 462 aa  99  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5143  integrase catalytic subunit  62.16 
 
 		 512 aa  98.6  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.1652 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4442  integrase catalytic region  63.51 
 
 		 512 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5758  integrase catalytic region  63.51 
 
 		 512 aa  97.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5652  integrase catalytic region  63.51 
 
 		 512 aa  97.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2672  integrase catalytic region  63.51 
 
 		 512 aa  96.7  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2991  integrase catalytic subunit  63.51 
 
 		 512 aa  96.7  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0181  Integrase catalytic region  62.16 
 
 		 385 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1110  integrase catalytic region  62.16 
 
 		 512 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1529  integrase catalytic subunit  60.81 
 
 		 505 aa  95.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.544255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1532  integrase catalytic subunit  60.81 
 
 		 505 aa  95.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7482  integrase catalytic region  60.81 
 
 		 191 aa  94.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0156  transposase InsG for insertion sequence IS1353  56.76 
 
 		 514 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0033  transposase  59.46 
 
 		 83 aa  90.9  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03230  transposase  58.11 
 
 		 209 aa  88.6  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.330594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3440  integrase catalytic region  59.38 
 
 		 533 aa  81.3  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.257291 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1803  transposase  56.76 
 
 		 73 aa  79.3  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0740053  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0997  transposase  56.76 
 
 		 522 aa  78.6  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0170218  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0806  putative transposase IS3/IS911  63.04 
 
 		 548 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0729  Integrase catalytic region  51.61 
 
 		 544 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2415  transposase  46.27 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  49.25 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1417  IS861, transposase (orf2), IS3 family, truncated  46.27 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1068  IS861, transposase OrfB  46.27 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1527  IS861, transposase OrfB  46.27 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1071  Integrase catalytic region  50 
 
 		 544 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.296403  hitchhiker  0.000000028101 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0018  transposase  46.27 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0101  transposase  46.27 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.163137  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1573  Integrase catalytic region  45.71 
 
 		 266 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1595  Integrase catalytic region  45.71 
 
 		 266 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2371  Integrase catalytic region  45.71 
 
 		 266 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0208  Integrase catalytic region  45.71 
 
 		 266 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0905  Integrase catalytic region  45.71 
 
 		 266 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000083708  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1163  Integrase catalytic region  45.71 
 
 		 266 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1209  Integrase catalytic region  45.71 
 
 		 266 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4363  transposase  46.27 
 
 		 215 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267789  hitchhiker  2.99756e-22 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1378  Integrase catalytic region  45.71 
 
 		 266 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1584  Integrase catalytic region  45.71 
 
 		 266 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2154  Integrase catalytic region  45.71 
 
 		 266 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C34  transposase  43.28 
 
 		 298 aa  63.9  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1197  IS3-family transposase, OrfB  48.65 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0109  IS3-family transposase, OrfB  48.65 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0514465  hitchhiker  0.00000245789 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  47.89 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  47.89 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0416  transposase  43.28 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0878674  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0662  transposase  43.28 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0882  transposase  43.28 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1035  transposase  43.28 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0448539  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1085  transposase  43.28 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1670  transposase  43.28 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  48.65 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  48.65 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  46.27 
 
 		 270 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  46.27 
 
 		 270 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  46.27 
 
 		 270 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 268 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 268 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 268 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  47.76 
 
 		 268 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1478  integrase catalytic subunit  45.95 
 
 		 252 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.168577  normal  0.117043 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1362  integrase catalytic subunit  45.95 
 
 		 252 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397787 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1091  integrase catalytic subunit  45.95 
 
 		 252 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1055  integrase catalytic subunit  45.95 
 
 		 252 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  43.24 
 
 		 279 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  43.24 
 
 		 279 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  43.24 
 
 		 279 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  43.24 
 
 		 279 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3594  transposase, IS3 family  44.59 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124578 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1165  integrase catalytic region  49.25 
 
 		 222 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000468999 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1339  integrase catalytic region  49.25 
 
 		 278 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0288  integrase catalytic region  49.25 
 
 		 278 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.010827  normal  0.364185 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3939  integrase catalytic region  49.25 
 
 		 278 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997818  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5561  integrase catalytic region  49.25 
 
 		 278 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.319693 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3343  transposase  44.59 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0814  integrase catalytic subunit  49.25 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1446  integrase catalytic subunit  49.25 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2564  integrase catalytic subunit  49.25 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2714  integrase catalytic subunit  49.25 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6205  integrase catalytic subunit  49.25 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346125  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  49.25 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  49.25 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  49.25 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  49.25 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5066  ISPsy8, transposase OrfB  47.76 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1458  integrase catalytic region  47.76 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31397  normal  0.395934 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3346  integrase catalytic region  47.76 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0096806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2397  integrase catalytic region  47.76 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.861552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2938  integrase catalytic region  47.76 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3912  integrase catalytic region  47.76 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553017  normal  0.660901 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4456  integrase catalytic region  47.76 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1740  integrase catalytic region  47.76 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  hitchhiker  0.000236948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2727  integrase catalytic region  47.76 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3208  Integrase catalytic region  43.24 
 
 		 277 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928461 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5509  ISPsy8, transposase OrfB  47.76 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>