More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1035 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0662  transposase  99.63 
 
 
273 aa  570  1.0000000000000001e-162  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1035  transposase  100 
 
 
273 aa  573  1.0000000000000001e-162  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0448539  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1085  transposase  100 
 
 
273 aa  573  1.0000000000000001e-162  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0882  transposase  99.63 
 
 
272 aa  565  1e-160  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0416  transposase  98.9 
 
 
272 aa  561  1.0000000000000001e-159  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0878674  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C34  transposase  97.44 
 
 
298 aa  553  1e-156  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1670  transposase  99.59 
 
 
243 aa  505  9.999999999999999e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2415  transposase  79.26 
 
 
287 aa  451  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1209  Integrase catalytic region  60.15 
 
 
266 aa  320  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1573  Integrase catalytic region  60.15 
 
 
266 aa  320  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0208  Integrase catalytic region  60.15 
 
 
266 aa  320  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0905  Integrase catalytic region  60.15 
 
 
266 aa  320  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000083708  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1163  Integrase catalytic region  60.15 
 
 
266 aa  320  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1378  Integrase catalytic region  60.15 
 
 
266 aa  320  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1595  Integrase catalytic region  60.15 
 
 
266 aa  320  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1584  Integrase catalytic region  60.15 
 
 
266 aa  320  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2154  Integrase catalytic region  60.15 
 
 
266 aa  320  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2371  Integrase catalytic region  60.15 
 
 
266 aa  320  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0852  transposase  79.21 
 
 
181 aa  296  2e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00092781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3662  integrase core domain protein  45.02 
 
 
265 aa  219  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  44.03 
 
 
270 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  44.03 
 
 
270 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  44.03 
 
 
270 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0307  transposase orfB, IS150-related  44.28 
 
 
269 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3620  transposase  44.28 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0498053  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  43.91 
 
 
267 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  43.91 
 
 
267 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0026  transposase  44.03 
 
 
269 aa  208  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1527  IS861, transposase OrfB  43.17 
 
 
277 aa  207  1e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  45.39 
 
 
278 aa  208  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  41.79 
 
 
268 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  41.04 
 
 
268 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1068  IS861, transposase OrfB  42.8 
 
 
277 aa  206  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  41.42 
 
 
268 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  41.42 
 
 
268 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0124  ISPsy8, transposase OrfB  42.53 
 
 
259 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0450  ISPsy8, transposase OrfB  42.53 
 
 
259 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0516  ISPsy8, transposase OrfB  42.53 
 
 
259 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5509  ISPsy8, transposase OrfB  42.53 
 
 
259 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359281  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  41.42 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  41.42 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5561  integrase catalytic region  40 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.319693 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0288  integrase catalytic region  40 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.010827  normal  0.364185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1339  integrase catalytic region  40 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327623 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  41.42 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  41.42 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3939  integrase catalytic region  40 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997818  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5066  ISPsy8, transposase OrfB  42.53 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1432  integrase catalytic subunit  43.02 
 
 
270 aa  199  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0298  integrase catalytic subunit  43.02 
 
 
270 aa  199  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  41.64 
 
 
283 aa  198  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  41.64 
 
 
283 aa  198  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  41.64 
 
 
283 aa  198  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  41.64 
 
 
283 aa  198  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  41.64 
 
 
283 aa  198  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  41.64 
 
 
283 aa  198  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  41.64 
 
 
283 aa  198  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  41.64 
 
 
283 aa  198  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  41.64 
 
 
283 aa  198  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  41.64 
 
 
283 aa  198  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  41.64 
 
 
283 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  41.64 
 
 
283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0006  IS3 family transposase  42.8 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149374 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  41.04 
 
 
278 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  41.04 
 
 
269 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  41.04 
 
 
278 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0194  transposase  43.36 
 
 
253 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501333  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1459  IS3 family transposase  42.42 
 
 
261 aa  195  6e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000914872  normal  0.0630219 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1788  IS3 family transposase  42.42 
 
 
261 aa  195  6e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2397  integrase catalytic region  44.69 
 
 
248 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.861552 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3912  integrase catalytic region  44.69 
 
 
248 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553017  normal  0.660901 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3346  integrase catalytic region  44.69 
 
 
248 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0096806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2938  integrase catalytic region  44.69 
 
 
248 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1197  IS3-family transposase, OrfB  44.9 
 
 
249 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1740  integrase catalytic region  44.69 
 
 
248 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  hitchhiker  0.000236948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1458  integrase catalytic region  44.69 
 
 
248 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31397  normal  0.395934 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0109  IS3-family transposase, OrfB  44.9 
 
 
249 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0514465  hitchhiker  0.00000245789 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4456  integrase catalytic region  44.69 
 
 
248 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1362  integrase catalytic subunit  42.13 
 
 
252 aa  192  5e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0397787 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1055  integrase catalytic subunit  42.13 
 
 
252 aa  192  5e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1091  integrase catalytic subunit  42.13 
 
 
252 aa  192  5e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2727  integrase catalytic region  44.69 
 
 
248 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74831  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1478  integrase catalytic subunit  42.13 
 
 
252 aa  192  5e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.168577  normal  0.117043 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  40.67 
 
 
278 aa  192  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4363  transposase  47.17 
 
 
215 aa  192  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267789  hitchhiker  2.99756e-22 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6205  integrase catalytic subunit  39.25 
 
 
260 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346125  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0814  integrase catalytic subunit  39.54 
 
 
278 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1446  integrase catalytic subunit  39.54 
 
 
278 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2564  integrase catalytic subunit  39.54 
 
 
278 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2714  integrase catalytic subunit  39.54 
 
 
278 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  39.55 
 
 
278 aa  188  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  39.55 
 
 
278 aa  188  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0974  Integrase catalytic region  39.93 
 
 
277 aa  188  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382547  normal  0.109209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2945  Integrase catalytic region  39.93 
 
 
277 aa  188  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0817746  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3208  Integrase catalytic region  39.93 
 
 
277 aa  188  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.928461 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0392  integrase catalytic subunit  45.22 
 
 
252 aa  188  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.231863  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0748  integrase catalytic subunit  45.22 
 
 
252 aa  188  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.401665  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1714  transposase  39.55 
 
 
278 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  38.06 
 
 
278 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2437  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 
261 aa  185  6e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>