More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1163 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1209  Integrase catalytic region  100 
 
 
266 aa  557  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1163  Integrase catalytic region  100 
 
 
266 aa  557  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0208  Integrase catalytic region  100 
 
 
266 aa  557  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2154  Integrase catalytic region  100 
 
 
266 aa  557  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1573  Integrase catalytic region  100 
 
 
266 aa  557  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1584  Integrase catalytic region  100 
 
 
266 aa  557  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1595  Integrase catalytic region  100 
 
 
266 aa  557  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0905  Integrase catalytic region  100 
 
 
266 aa  557  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000083708  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1378  Integrase catalytic region  100 
 
 
266 aa  557  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2371  Integrase catalytic region  100 
 
 
266 aa  557  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2415  transposase  61.92 
 
 
287 aa  332  4e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0416  transposase  60.77 
 
 
272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0878674  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0882  transposase  60.38 
 
 
272 aa  325  4.0000000000000003e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C34  transposase  59.62 
 
 
298 aa  321  9.999999999999999e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1035  transposase  60.15 
 
 
273 aa  320  9.999999999999999e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0448539  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1085  transposase  60.15 
 
 
273 aa  320  9.999999999999999e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0662  transposase  60.15 
 
 
273 aa  319  1.9999999999999998e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1670  transposase  61.73 
 
 
243 aa  306  3e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  45.86 
 
 
270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  45.86 
 
 
270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  45.86 
 
 
270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  45.72 
 
 
267 aa  215  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  45.72 
 
 
267 aa  215  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0852  transposase  58.56 
 
 
181 aa  215  5.9999999999999996e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00092781  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1527  IS861, transposase OrfB  45.66 
 
 
277 aa  211  9e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1068  IS861, transposase OrfB  45.28 
 
 
277 aa  209  3e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0124  ISPsy8, transposase OrfB  44.49 
 
 
259 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0450  ISPsy8, transposase OrfB  44.49 
 
 
259 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0516  ISPsy8, transposase OrfB  44.49 
 
 
259 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5509  ISPsy8, transposase OrfB  44.49 
 
 
259 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3662  integrase core domain protein  44.87 
 
 
265 aa  209  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5066  ISPsy8, transposase OrfB  44.49 
 
 
259 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  44.78 
 
 
279 aa  208  8e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  44.78 
 
 
279 aa  208  8e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  44.78 
 
 
279 aa  208  8e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  44.78 
 
 
279 aa  208  8e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1197  IS3-family transposase, OrfB  45.8 
 
 
249 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0109  IS3-family transposase, OrfB  45.8 
 
 
249 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0514465  hitchhiker  0.00000245789 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  43.68 
 
 
268 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3620  transposase  44.49 
 
 
265 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0498053  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  43.3 
 
 
268 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  43.3 
 
 
268 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  42.91 
 
 
268 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0307  transposase orfB, IS150-related  44.11 
 
 
269 aa  206  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1458  integrase catalytic region  45.45 
 
 
248 aa  205  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31397  normal  0.395934 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4456  integrase catalytic region  45.45 
 
 
248 aa  205  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1740  integrase catalytic region  45.45 
 
 
248 aa  205  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  hitchhiker  0.000236948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2938  integrase catalytic region  45.45 
 
 
248 aa  205  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3912  integrase catalytic region  45.45 
 
 
248 aa  205  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553017  normal  0.660901 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3346  integrase catalytic region  45.45 
 
 
248 aa  205  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0096806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2397  integrase catalytic region  45.45 
 
 
248 aa  205  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.861552 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  44.53 
 
 
278 aa  205  6e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2727  integrase catalytic region  45.06 
 
 
248 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74831  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5561  integrase catalytic region  43.92 
 
 
278 aa  203  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.319693 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1339  integrase catalytic region  43.92 
 
 
278 aa  201  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0288  integrase catalytic region  43.92 
 
 
278 aa  201  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.010827  normal  0.364185 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0026  transposase  44.23 
 
 
269 aa  202  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3939  integrase catalytic region  43.92 
 
 
278 aa  201  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997818  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0298  integrase catalytic subunit  42.32 
 
 
270 aa  198  7.999999999999999e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1432  integrase catalytic subunit  42.32 
 
 
270 aa  198  7.999999999999999e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6205  integrase catalytic subunit  43.53 
 
 
260 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346125  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0814  integrase catalytic subunit  43.53 
 
 
278 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1446  integrase catalytic subunit  43.53 
 
 
278 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2564  integrase catalytic subunit  43.53 
 
 
278 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2714  integrase catalytic subunit  43.53 
 
 
278 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  44.19 
 
 
278 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  44.19 
 
 
269 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  44.19 
 
 
278 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  43.8 
 
 
278 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4363  transposase  46.02 
 
 
215 aa  191  9e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267789  hitchhiker  2.99756e-22 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0194  transposase  43.67 
 
 
253 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501333  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1165  integrase catalytic region  43.59 
 
 
222 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000468999 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  42.11 
 
 
278 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1055  integrase catalytic subunit  41.06 
 
 
252 aa  185  7e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1362  integrase catalytic subunit  41.06 
 
 
252 aa  185  7e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0397787 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1091  integrase catalytic subunit  41.06 
 
 
252 aa  185  7e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1478  integrase catalytic subunit  41.06 
 
 
252 aa  185  7e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.168577  normal  0.117043 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  39.92 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  39.92 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  41.5 
 
 
283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  41.5 
 
 
283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  41.5 
 
 
283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  41.5 
 
 
283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  41.5 
 
 
283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  41.5 
 
 
283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  41.5 
 
 
283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  41.5 
 
 
283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  41.5 
 
 
283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  41.5 
 
 
283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  41.5 
 
 
283 aa  182  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1714  transposase  43.65 
 
 
278 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  41.5 
 
 
283 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0273  integrase catalytic subunit  40.45 
 
 
278 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0592  integrase catalytic subunit  40.45 
 
 
278 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398355  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1176  integrase catalytic subunit  40.45 
 
 
278 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.155999  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4616  integrase catalytic subunit  40.45 
 
 
278 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.698457  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4680  integrase catalytic subunit  40.45 
 
 
278 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0006  IS3 family transposase  42.06 
 
 
261 aa  181  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149374 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1459  IS3 family transposase  42.06 
 
 
261 aa  181  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000914872  normal  0.0630219 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1788  IS3 family transposase  42.06 
 
 
261 aa  181  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>