More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_C34 on replicon NC_008505
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008505  LACR_C34  transposase  100 
 
 		 298 aa  623  1e-177  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0416  transposase  98.53 
 
 		 272 aa  564  1e-160  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0878674  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0882  transposase  97.79 
 
 		 272 aa  558  1e-158  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0662  transposase  97.8 
 
 		 273 aa  556  1e-157  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1035  transposase  97.44 
 
 		 273 aa  553  1e-156  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0448539  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1085  transposase  97.44 
 
 		 273 aa  553  1e-156  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1670  transposase  97.94 
 
 		 243 aa  493  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2415  transposase  76.49 
 
 		 287 aa  461  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1573  Integrase catalytic region  59.62 
 
 		 266 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0208  Integrase catalytic region  59.62 
 
 		 266 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1378  Integrase catalytic region  59.62 
 
 		 266 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0905  Integrase catalytic region  59.62 
 
 		 266 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000083708  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1209  Integrase catalytic region  59.62 
 
 		 266 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1584  Integrase catalytic region  59.62 
 
 		 266 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2154  Integrase catalytic region  59.62 
 
 		 266 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1595  Integrase catalytic region  59.62 
 
 		 266 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2371  Integrase catalytic region  59.62 
 
 		 266 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1163  Integrase catalytic region  59.62 
 
 		 266 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0852  transposase  78.53 
 
 		 181 aa  298  7e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00092781  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0307  transposase orfB, IS150-related  43.07 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3662  integrase core domain protein  43.7 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  42.44 
 
 		 270 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  42.44 
 
 		 270 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  42.44 
 
 		 270 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1527  IS861, transposase OrfB  43.12 
 
 		 277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1068  IS861, transposase OrfB  42.75 
 
 		 277 aa  211  7.999999999999999e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  44.57 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3620  transposase  42.96 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0498053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0026  transposase  42.8 
 
 		 269 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  42.8 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  42.8 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  40.79 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  40.79 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  40.79 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  40.79 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  40.67 
 
 		 268 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.259629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  40.28 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  40.28 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  40.28 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  40.28 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  40.28 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  40.28 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  39.93 
 
 		 268 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  40.28 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  40.28 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  40.28 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  40.28 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  40.28 
 
 		 283 aa  202  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  40.3 
 
 		 268 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  40.3 
 
 		 268 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  40.28 
 
 		 283 aa  202  7e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5561  integrase catalytic region  39.07 
 
 		 278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.319693 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3939  integrase catalytic region  38.71 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997818  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1339  integrase catalytic region  38.71 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0288  integrase catalytic region  38.71 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.010827  normal  0.364185 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1432  integrase catalytic subunit  41.76 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0298  integrase catalytic subunit  41.76 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0124  ISPsy8, transposase OrfB  41.15 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0450  ISPsy8, transposase OrfB  41.15 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0516  ISPsy8, transposase OrfB  41.15 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5509  ISPsy8, transposase OrfB  41.15 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359281  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  39.57 
 
 		 278 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  39.57 
 
 		 278 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5066  ISPsy8, transposase OrfB  41.15 
 
 		 259 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0194  transposase  42.08 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501333  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  39.21 
 
 		 278 aa  192  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  39.48 
 
 		 269 aa  192  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0006  IS3 family transposase  41.44 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149374 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1197  IS3-family transposase, OrfB  43.85 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0109  IS3-family transposase, OrfB  43.85 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0514465  hitchhiker  0.00000245789 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1459  IS3 family transposase  41.06 
 
 		 261 aa  189  5e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000914872  normal  0.0630219 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1788  IS3 family transposase  41.06 
 
 		 261 aa  189  5e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  37.18 
 
 		 278 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1362  integrase catalytic subunit  40.71 
 
 		 252 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397787 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1091  integrase catalytic subunit  40.71 
 
 		 252 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1055  integrase catalytic subunit  40.71 
 
 		 252 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  38.57 
 
 		 278 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  38.57 
 
 		 278 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1478  integrase catalytic subunit  40.71 
 
 		 252 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.168577  normal  0.117043 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3346  integrase catalytic region  43.56 
 
 		 248 aa  185  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0096806 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1714  transposase  37.86 
 
 		 278 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1458  integrase catalytic region  43.56 
 
 		 248 aa  185  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31397  normal  0.395934 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4456  integrase catalytic region  43.56 
 
 		 248 aa  185  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3912  integrase catalytic region  43.56 
 
 		 248 aa  185  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553017  normal  0.660901 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2938  integrase catalytic region  43.56 
 
 		 248 aa  185  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1740  integrase catalytic region  43.56 
 
 		 248 aa  185  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  hitchhiker  0.000236948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2397  integrase catalytic region  43.56 
 
 		 248 aa  185  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.861552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2727  integrase catalytic region  43.56 
 
 		 248 aa  185  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4363  transposase  45.54 
 
 		 215 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267789  hitchhiker  2.99756e-22 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0392  integrase catalytic subunit  43.67 
 
 		 252 aa  183  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0748  integrase catalytic subunit  43.67 
 
 		 252 aa  183  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.401665  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0273  integrase catalytic subunit  39.43 
 
 		 278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0592  integrase catalytic subunit  39.43 
 
 		 278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398355  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1176  integrase catalytic subunit  39.43 
 
 		 278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.155999  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4616  integrase catalytic subunit  39.43 
 
 		 278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.698457  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4680  integrase catalytic subunit  39.43 
 
 		 278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2945  Integrase catalytic region  38.35 
 
 		 277 aa  182  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0817746  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0974  Integrase catalytic region  38.35 
 
 		 277 aa  182  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382547  normal  0.109209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3208  Integrase catalytic region  38.35 
 
 		 277 aa  182  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928461 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5018  ISPsy9, transposase OrfB  39.43 
 
 		 278 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>