More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0006 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0006  IS3 family transposase  100 
 
 
261 aa  539  9.999999999999999e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149374 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1459  IS3 family transposase  99.62 
 
 
261 aa  536  1e-151  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000914872  normal  0.0630219 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1788  IS3 family transposase  99.23 
 
 
261 aa  535  1e-151  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0717  integrase catalytic subunit  81.92 
 
 
261 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.558663  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0848  integrase catalytic subunit  81.92 
 
 
261 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1577  integrase catalytic subunit  81.92 
 
 
261 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.279406  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2077  integrase catalytic subunit  81.92 
 
 
261 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.74373  normal  0.201044 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2412  integrase catalytic subunit  81.92 
 
 
261 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.714231 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2437  integrase catalytic subunit  81.92 
 
 
261 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0392  integrase catalytic subunit  75 
 
 
252 aa  394  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.231863  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0748  integrase catalytic subunit  75 
 
 
252 aa  394  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.401665  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  55.43 
 
 
278 aa  315  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  55.43 
 
 
278 aa  315  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  52.9 
 
 
283 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  52.9 
 
 
283 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  52.9 
 
 
283 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  52.9 
 
 
283 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  52.9 
 
 
283 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  52.9 
 
 
283 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  52.9 
 
 
283 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  52.9 
 
 
283 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  52.9 
 
 
283 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  52.9 
 
 
283 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  52.9 
 
 
283 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  52.51 
 
 
283 aa  304  9.000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  55.38 
 
 
278 aa  299  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  55.38 
 
 
269 aa  299  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  55.38 
 
 
278 aa  299  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  53.88 
 
 
278 aa  296  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  55 
 
 
278 aa  296  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6205  integrase catalytic subunit  55.38 
 
 
260 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346125  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  55 
 
 
279 aa  293  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  55 
 
 
279 aa  293  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  55 
 
 
279 aa  293  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  55 
 
 
279 aa  293  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0814  integrase catalytic subunit  55.43 
 
 
278 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1446  integrase catalytic subunit  55.43 
 
 
278 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2564  integrase catalytic subunit  55.43 
 
 
278 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2714  integrase catalytic subunit  55.43 
 
 
278 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1714  transposase  52.31 
 
 
278 aa  292  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5561  integrase catalytic region  53.85 
 
 
278 aa  290  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.319693 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3939  integrase catalytic region  53.85 
 
 
278 aa  289  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997818  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1339  integrase catalytic region  53.85 
 
 
278 aa  289  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0288  integrase catalytic region  53.85 
 
 
278 aa  289  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.010827  normal  0.364185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2727  integrase catalytic region  54.69 
 
 
248 aa  289  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74831  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5018  ISPsy9, transposase OrfB  53.64 
 
 
278 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0273  integrase catalytic subunit  53.64 
 
 
278 aa  288  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0592  integrase catalytic subunit  53.64 
 
 
278 aa  288  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398355  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1176  integrase catalytic subunit  53.64 
 
 
278 aa  288  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.155999  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4616  integrase catalytic subunit  53.64 
 
 
278 aa  288  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.698457  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4680  integrase catalytic subunit  53.64 
 
 
278 aa  288  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3346  integrase catalytic region  54.29 
 
 
248 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0096806 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0124  ISPsy8, transposase OrfB  52.12 
 
 
259 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0450  ISPsy8, transposase OrfB  52.12 
 
 
259 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0516  ISPsy8, transposase OrfB  52.12 
 
 
259 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5509  ISPsy8, transposase OrfB  52.12 
 
 
259 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359281  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4456  integrase catalytic region  54.29 
 
 
248 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2938  integrase catalytic region  54.29 
 
 
248 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1458  integrase catalytic region  54.29 
 
 
248 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31397  normal  0.395934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1740  integrase catalytic region  54.29 
 
 
248 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  hitchhiker  0.000236948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2397  integrase catalytic region  54.29 
 
 
248 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.861552 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3912  integrase catalytic region  54.29 
 
 
248 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553017  normal  0.660901 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5066  ISPsy8, transposase OrfB  52.12 
 
 
259 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1432  integrase catalytic subunit  53.46 
 
 
270 aa  285  7e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0298  integrase catalytic subunit  53.46 
 
 
270 aa  285  7e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  51.35 
 
 
268 aa  284  9e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  51.35 
 
 
268 aa  284  9e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  51.54 
 
 
267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  51.54 
 
 
267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  52.49 
 
 
270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  52.49 
 
 
270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  52.49 
 
 
270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  50.97 
 
 
268 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  50.97 
 
 
268 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1055  integrase catalytic subunit  53.88 
 
 
252 aa  276  4e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1362  integrase catalytic subunit  53.88 
 
 
252 aa  276  4e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0397787 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0109  IS3-family transposase, OrfB  53.06 
 
 
249 aa  275  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0514465  hitchhiker  0.00000245789 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1091  integrase catalytic subunit  53.88 
 
 
252 aa  276  4e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1197  IS3-family transposase, OrfB  53.06 
 
 
249 aa  275  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1478  integrase catalytic subunit  53.88 
 
 
252 aa  276  4e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.168577  normal  0.117043 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3208  Integrase catalytic region  50.78 
 
 
277 aa  275  7e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.928461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0974  Integrase catalytic region  50.78 
 
 
277 aa  275  7e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382547  normal  0.109209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2945  Integrase catalytic region  50.78 
 
 
277 aa  275  7e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0817746  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0026  transposase  49.42 
 
 
269 aa  260  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3662  integrase core domain protein  49.03 
 
 
265 aa  259  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3620  transposase  49.42 
 
 
265 aa  259  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0498053  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0307  transposase orfB, IS150-related  48.64 
 
 
269 aa  258  9e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0908  integrase core subunit  51.74 
 
 
261 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3998  integrase core subunit  51.74 
 
 
261 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0196  integrase core subunit  51.74 
 
 
261 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0350068 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4172  integrase core subunit  51.74 
 
 
261 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3804  integrase core subunit  51.74 
 
 
261 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3902  integrase core subunit  51.74 
 
 
261 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3759  integrase core subunit  51.74 
 
 
261 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3122  integrase core subunit  51.74 
 
 
261 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00391606  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4363  transposase  56.25 
 
 
215 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267789  hitchhiker  2.99756e-22 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  50.94 
 
 
278 aa  251  6e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1165  integrase catalytic region  54.79 
 
 
222 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000468999 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1068  IS861, transposase OrfB  47.53 
 
 
277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0194  transposase  47.13 
 
 
253 aa  243  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>