More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0852 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0852  transposase  100 
 
 		 181 aa  377  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00092781  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2415  transposase  98.87 
 
 		 287 aa  364  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0416  transposase  79.66 
 
 		 272 aa  303  1.0000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0878674  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0882  transposase  79.66 
 
 		 272 aa  301  4.0000000000000003e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0662  transposase  79.78 
 
 		 273 aa  300  9e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C34  transposase  78.53 
 
 		 298 aa  298  2e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1035  transposase  79.21 
 
 		 273 aa  296  9e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0448539  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1085  transposase  79.21 
 
 		 273 aa  296  9e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1670  transposase  80.92 
 
 		 243 aa  296  9e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1163  Integrase catalytic region  58.56 
 
 		 266 aa  215  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1209  Integrase catalytic region  58.56 
 
 		 266 aa  215  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0208  Integrase catalytic region  58.56 
 
 		 266 aa  215  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2154  Integrase catalytic region  58.56 
 
 		 266 aa  215  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1573  Integrase catalytic region  58.56 
 
 		 266 aa  215  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1584  Integrase catalytic region  58.56 
 
 		 266 aa  215  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1595  Integrase catalytic region  58.56 
 
 		 266 aa  215  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2371  Integrase catalytic region  58.56 
 
 		 266 aa  215  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0905  Integrase catalytic region  58.56 
 
 		 266 aa  215  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000083708  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1378  Integrase catalytic region  58.56 
 
 		 266 aa  215  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398222  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3662  integrase core domain protein  48.45 
 
 		 265 aa  148  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0307  transposase orfB, IS150-related  47.83 
 
 		 269 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3620  transposase  47.83 
 
 		 265 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0498053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0026  transposase  47.2 
 
 		 269 aa  143  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0194  transposase  45.96 
 
 		 253 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501333  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0006  IS3 family transposase  46.3 
 
 		 261 aa  135  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  46.3 
 
 		 270 aa  134  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  46.3 
 
 		 270 aa  134  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  46.3 
 
 		 270 aa  134  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1459  IS3 family transposase  45.68 
 
 		 261 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000914872  normal  0.0630219 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1788  IS3 family transposase  45.68 
 
 		 261 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1055  integrase catalytic subunit  41.57 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1478  integrase catalytic subunit  41.57 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.168577  normal  0.117043 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1362  integrase catalytic subunit  41.57 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397787 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1091  integrase catalytic subunit  41.57 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0392  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 		 252 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0748  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 		 252 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.401665  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  42.78 
 
 		 267 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  42.78 
 
 		 267 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0109  IS3-family transposase, OrfB  42.78 
 
 		 249 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0514465  hitchhiker  0.00000245789 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1197  IS3-family transposase, OrfB  42.78 
 
 		 249 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4363  transposase  47.33 
 
 		 215 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267789  hitchhiker  2.99756e-22 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0298  integrase catalytic subunit  45.34 
 
 		 270 aa  125  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1432  integrase catalytic subunit  45.34 
 
 		 270 aa  125  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0124  ISPsy8, transposase OrfB  40.99 
 
 		 259 aa  124  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0450  ISPsy8, transposase OrfB  40.99 
 
 		 259 aa  124  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0516  ISPsy8, transposase OrfB  40.99 
 
 		 259 aa  124  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5509  ISPsy8, transposase OrfB  40.99 
 
 		 259 aa  124  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359281  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  42.86 
 
 		 279 aa  124  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  42.86 
 
 		 279 aa  124  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  43.48 
 
 		 278 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  43.48 
 
 		 269 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  43.48 
 
 		 278 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  42.86 
 
 		 279 aa  124  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  42.86 
 
 		 279 aa  124  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  40.99 
 
 		 268 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  40.99 
 
 		 268 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  40.99 
 
 		 268 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5066  ISPsy8, transposase OrfB  40.99 
 
 		 259 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  40.37 
 
 		 268 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0717  integrase catalytic subunit  40.45 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.558663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0848  integrase catalytic subunit  40.45 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1577  integrase catalytic subunit  40.45 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.279406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2077  integrase catalytic subunit  40.45 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.74373  normal  0.201044 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2412  integrase catalytic subunit  40.45 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.714231 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2437  integrase catalytic subunit  40.45 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  44.44 
 
 		 278 aa  123  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3346  integrase catalytic region  40.37 
 
 		 248 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0096806 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3912  integrase catalytic region  40.37 
 
 		 248 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553017  normal  0.660901 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4456  integrase catalytic region  40.37 
 
 		 248 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2727  integrase catalytic region  40.37 
 
 		 248 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2938  integrase catalytic region  40.37 
 
 		 248 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2397  integrase catalytic region  40.37 
 
 		 248 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.861552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1458  integrase catalytic region  40.37 
 
 		 248 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31397  normal  0.395934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1740  integrase catalytic region  40.37 
 
 		 248 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  hitchhiker  0.000236948 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  42.86 
 
 		 278 aa  121  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1068  IS861, transposase OrfB  43.03 
 
 		 277 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1527  IS861, transposase OrfB  43.03 
 
 		 277 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  43.21 
 
 		 278 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  43.21 
 
 		 278 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0974  Integrase catalytic region  39.51 
 
 		 277 aa  117  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382547  normal  0.109209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2945  Integrase catalytic region  39.51 
 
 		 277 aa  117  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0817746  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3208  Integrase catalytic region  39.51 
 
 		 277 aa  117  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928461 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5561  integrase catalytic region  39.63 
 
 		 278 aa  117  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.319693 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6205  integrase catalytic subunit  39.51 
 
 		 260 aa  117  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0814  integrase catalytic subunit  39.75 
 
 		 278 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1446  integrase catalytic subunit  39.75 
 
 		 278 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2564  integrase catalytic subunit  39.75 
 
 		 278 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2714  integrase catalytic subunit  39.75 
 
 		 278 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3939  integrase catalytic region  39.63 
 
 		 278 aa  117  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997818  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0288  integrase catalytic region  39.63 
 
 		 278 aa  117  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.010827  normal  0.364185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1339  integrase catalytic region  39.63 
 
 		 278 aa  117  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327623 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  41.61 
 
 		 283 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  41.61 
 
 		 283 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  41.61 
 
 		 283 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  41.61 
 
 		 283 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  41.61 
 
 		 283 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  41.61 
 
 		 283 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  41.61 
 
 		 283 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  41.61 
 
 		 283 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  41.61 
 
 		 283 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.274968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>