More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_4626 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_4626  germination protein GerE  100 
 
 		 61 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193317  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4385  germination protein GerE  98.04 
 
 		 74 aa  103  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4226  germination protein  98.04 
 
 		 74 aa  103  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4238  germination protein  98.04 
 
 		 74 aa  103  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4724  germination protein GerE  98.04 
 
 		 74 aa  103  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.105908  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4329  LuxR family transcriptional regulator  98.04 
 
 		 74 aa  103  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0626  germination protein GerE  98.04 
 
 		 74 aa  103  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4629  germination protein GerE  98.04 
 
 		 74 aa  103  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4609  germination protein GerE  98.04 
 
 		 74 aa  103  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3205  response regulator receiver protein  94.12 
 
 		 74 aa  99.8  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.826126  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0846  transcriptional regulator, LuxR family  88.24 
 
 		 74 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2604  transcriptional regulator, LuxR family  86.27 
 
 		 74 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1854  transcriptional regulator, LuxR family  81.25 
 
 		 75 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  50.94 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.1 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.5 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  50 
 
 		 228 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 973 aa  52  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  47.73 
 
 		 227 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3409  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 221 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306896  hitchhiker  0.000114505 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1181  response regulator, positive activator of uhpT transcription  57.14 
 
 		 318 aa  51.2  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041551  decreased coverage  0.008996 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 242 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.73 
 
 		 225 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.38 
 
 		 217 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1384  LuxR family DNA-binding response regulator  48.15 
 
 		 207 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000639089  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1446  response regulator receiver protein  42.31 
 
 		 209 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0167897  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2681  LuxR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 361 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0438  transcriptional regulatory protein UhpA  55.56 
 
 		 209 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0622  transcriptional regulator UhpA  59.52 
 
 		 208 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  50 
 
 		 212 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  46.51 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  46.51 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  46.51 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6525  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.54 
 
 		 216 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  46.51 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  60 
 
 		 228 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 225 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3070  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 216 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000689776  unclonable  0.00000000000283062 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.66 
 
 		 225 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  46.51 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 238 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  48.84 
 
 		 213 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4906  response regulator receiver  50 
 
 		 205 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275081  normal  0.875639 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 213 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1241  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 216 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000399601  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  60 
 
 		 228 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4204  two component LuxR family transcriptional regulator  58.54 
 
 		 202 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00789571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 250 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.78 
 
 		 234 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 216 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  48.84 
 
 		 213 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1285  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 216 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000337392  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  57.5 
 
 		 212 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  46.51 
 
 		 209 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1319  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 216 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0542522  decreased coverage  0.000972679 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  57.5 
 
 		 212 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1255  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 219 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.490147  normal  0.40644 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  56.41 
 
 		 213 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.97 
 
 		 216 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7316  response regulator receiver protein  50 
 
 		 201 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 217 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.5 
 
 		 210 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 211 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  48.84 
 
 		 211 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1737  regulatory protein LuxR  54.17 
 
 		 231 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117285  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 219 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.24 
 
 		 223 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04820  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  58.54 
 
 		 229 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  57.5 
 
 		 212 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.76 
 
 		 210 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4437  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.1 
 
 		 218 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.784745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 201 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  55 
 
 		 233 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.81 
 
 		 218 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  55 
 
 		 231 aa  48.1  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2543  two component transcriptional regulator, LuxR family  55 
 
 		 217 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.473476  normal  0.787864 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.38 
 
 		 253 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6529  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.92 
 
 		 224 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal  0.114568 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 201 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  52.5 
 
 		 223 aa  47.8  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3086  LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 226 aa  47.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  52.38 
 
 		 954 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  45.83 
 
 		 210 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  45.83 
 
 		 210 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  45.83 
 
 		 210 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  45.83 
 
 		 210 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 210 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  45.83 
 
 		 210 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3280  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 223 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  45.83 
 
 		 210 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 303 aa  47.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  52.5 
 
 		 1006 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3033  two component transcriptional regulator, LuxR family  55 
 
 		 232 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666463  hitchhiker  0.000783277 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1698  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.66 
 
 		 207 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  51.28 
 
 		 967 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  45.83 
 
 		 210 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>