75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0408 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0408  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  623  1e-177  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0593  hypothetical protein  27.61 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0484  ribosomal protein S7  25.71 
 
 
266 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0479  hypothetical protein  31.14 
 
 
266 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3551  hypothetical protein  29.69 
 
 
280 aa  90.5  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.957801  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0752  hypothetical protein  33.77 
 
 
267 aa  86.7  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912911  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2753  hypothetical protein  30.43 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152909  normal  0.694513 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0787  hypothetical protein  36.22 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4349  hypothetical protein  34.92 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0982  hypothetical protein  36.67 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.809906  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6267  hypothetical protein  28.86 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38552  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0618  hypothetical protein  25.25 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.922972 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0531  hypothetical protein  30.08 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4503  hypothetical protein  34.92 
 
 
275 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.217777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6967  hypothetical protein  34.13 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364355  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6934  hypothetical protein  27.52 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0660  hypothetical protein  25.4 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.125463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1256  hypothetical protein  28.42 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0437  hypothetical protein  29.69 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0225  hypothetical protein  29.14 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120044  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3082  hypothetical protein  26.95 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0669434  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3607  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30 
 
 
734 aa  73.2  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3897  hypothetical protein  32.99 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.222076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2595  hypothetical protein  31.08 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1000  hypothetical protein  28.91 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1068  hypothetical protein  25.32 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3068  hypothetical protein  30.91 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.893095  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0758  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  25.44 
 
 
702 aa  70.9  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0717  hypothetical protein  37 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.365683 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0682  hypothetical protein  30.53 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2660  hypothetical protein  28.12 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.857145  normal  0.753629 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3350  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.01 
 
 
678 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1178  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  29.46 
 
 
628 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1189  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  29.46 
 
 
628 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.289009  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3407  thiol:disulfide interchange protein DsbD  24.86 
 
 
703 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.325788  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1224  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  28.68 
 
 
628 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal  0.545924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1209  membrane protein suppressor for copper-sensitivity B  24.74 
 
 
628 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.776669  normal  0.266538 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1073  membrane protein, suppressor for copper-sensitivity B  28.68 
 
 
628 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0114  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.84 
 
 
703 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.453155  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3200  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.52 
 
 
685 aa  63.9  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3005  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.38 
 
 
683 aa  63.9  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.123614  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4225  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.91 
 
 
703 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4153  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.91 
 
 
703 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00759916  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4357  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.91 
 
 
703 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3550  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  23.19 
 
 
710 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02847  hypothetical protein  29.25 
 
 
703 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3058  putative suppressor for copper-sensitivity B precursor  30.77 
 
 
715 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003038  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsB  26.78 
 
 
703 aa  59.3  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4648  thiol:disulfide interchange protein, putative  26.47 
 
 
715 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.938928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4281  thiol:disulfide interchange protein, putative  27.45 
 
 
692 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294342  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3686  putative suppressor for copper-sensitivity B  22.22 
 
 
702 aa  56.6  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141878  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0565  thiol:disulfide interchange protein, putative  27.7 
 
 
726 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4798  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.47 
 
 
709 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379301  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3779  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  30.53 
 
 
709 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4055  thiol:disulfide interchange protein DsbD 1 precursor  30.53 
 
 
709 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7374  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.95 
 
 
725 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4691  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.67 
 
 
738 aa  50.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.937324 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4257  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like  28.43 
 
 
738 aa  50.1  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0597  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.63 
 
 
704 aa  49.7  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681901 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6628  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.66 
 
 
734 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0587  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.56 
 
 
798 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0376  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.45 
 
 
715 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2338  thiol:disulfide interchange protein, putative  25.24 
 
 
724 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.624008  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0730  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.03 
 
 
717 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4456  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.7 
 
 
755 aa  47.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0567  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.67 
 
 
696 aa  47  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0442457  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1489  putative ThiO:disulfide interchange protein  28.57 
 
 
725 aa  46.6  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3127  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28 
 
 
738 aa  45.8  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5139  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  23.02 
 
 
700 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228449  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28 
 
 
738 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2160  hypothetical protein  27.18 
 
 
708 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0156  thiol-disulfide interchange protein DsbD-like protein  27 
 
 
748 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0748  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  30.93 
 
 
724 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00532426  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2043  thiol-disulfide interchange protein-like protein  26.79 
 
 
701 aa  42.7  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.476424  normal  0.478834 
 
 
-
 
NC_002620  TC0884  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  28.28 
 
 
692 aa  42.4  0.01  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>