50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_28590 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_28590  Peptidase M4, thermolysin propeptide  100 
 
 		 106 aa  206  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  62.86 
 
 		 104 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  62.86 
 
 		 104 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  63.81 
 
 		 104 aa  116  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  56.73 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  61.05 
 
 		 102 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  72.5 
 
 		 104 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29720  hypothetical protein  67.62 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2542  hypothetical protein  73.4 
 
 		 100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  58.25 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1994  peptidase  74.07 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  0.197441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  55.95 
 
 		 114 aa  97.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2541  hypothetical protein  46.23 
 
 		 102 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0415354  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29710  hypothetical protein  46.23 
 
 		 102 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1351  peptidase  53.01 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.207788  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  45.83 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3774  peptidase  45.78 
 
 		 102 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1993  peptidase  46.07 
 
 		 102 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872282  normal  0.14577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1785  peptidase  36.19 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.15986  normal  0.0473515 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2345  hypothetical protein  37.97 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.0000248352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1945  peptidase  37.5 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053357 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3351  peptidase  36.25 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3764  membrane protein  53.95 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.915458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  41.49 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4315  peptidase  37.14 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3383  hypothetical protein  34.78 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0287551  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  37.14 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0313  membrane protein  45.21 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  36.14 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3214  peptidase  32.18 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0240  peptidase  35.71 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0240  peptidase  34.52 
 
 		 88 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5131  hypothetical protein  32.35 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  34.52 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  34.52 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  35.71 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  35.14 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271334 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  35.14 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  33.78 
 
 		 88 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  35.48 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1609  hypothetical protein  30.38 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4486  hypothetical protein  35.82 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4084  membrane protein  34.72 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3770  peptidase  26.8 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3019  peptidase  40 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  39.71 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3687  peptidase  31.43 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.075913  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1884  peptidase  32 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2241  peptidase  37.1 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.043163  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0629  hypothetical protein  35.29 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000224973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>