34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3774 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3774  peptidase  100 
 
 		 102 aa  206  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2541  hypothetical protein  72.28 
 
 		 102 aa  156  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0415354  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29710  hypothetical protein  72.28 
 
 		 102 aa  156  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  65.35 
 
 		 102 aa  138  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1993  peptidase  60.82 
 
 		 102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872282  normal  0.14577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1785  peptidase  54.46 
 
 		 102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.15986  normal  0.0473515 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1351  peptidase  53.92 
 
 		 103 aa  121  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.207788  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2345  hypothetical protein  52.94 
 
 		 102 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.0000248352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3351  peptidase  52.94 
 
 		 102 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3214  peptidase  52.94 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1945  peptidase  57.5 
 
 		 102 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053357 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3383  hypothetical protein  51.96 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0287551  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1609  hypothetical protein  51.9 
 
 		 102 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3770  peptidase  41.75 
 
 		 102 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4315  peptidase  46.08 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  44.21 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  44.21 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  42.27 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  43.16 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  43.75 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  43.75 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  43.75 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1994  peptidase  45.54 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  0.197441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  44.3 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28590  Peptidase M4, thermolysin propeptide  47.5 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2542  hypothetical protein  41.41 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29720  hypothetical protein  44.9 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  37.11 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  38.57 
 
 		 106 aa  48.9  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  35.24 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5445  hypothetical protein  38.33 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0704203  normal  0.135047 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1138  hypothetical protein  36.07 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4930  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.325685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2241  peptidase  32.26 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.043163  normal  0.557208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>