18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4930 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4930  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  305  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.325685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3531  hypothetical protein  35.66 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.325005 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1409  hypothetical protein  27.21 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.523935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0893  hypothetical protein  29.5 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3916  hypothetical protein  29.66 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00240375  hitchhiker  0.00943034 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1928  hypothetical protein  27.15 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.344998  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0895  hypothetical protein  26.36 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1108  hypothetical protein  31.33 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.843935  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6957  hypothetical protein  24.43 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329306  normal  0.232269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1945  peptidase  33.33 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053357 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2911  hypothetical protein  25.78 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.215137 
 
 
-
 
NC_002950  PG0717  putative lipoprotein  28.85 
 
 		 367 aa  43.5  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.129076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3774  peptidase  33.33 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2345  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.0000248352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3351  peptidase  33.33 
 
 		 102 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6738  hypothetical protein  24.79 
 
 		 152 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.396339 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6958  hypothetical protein  23.93 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.141426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1993  peptidase  31.48 
 
 		 102 aa  40  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872282  normal  0.14577 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>