19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1928 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1928  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  322  1e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.344998  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1409  hypothetical protein  29.2 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.523935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2438  hypothetical protein  31.01 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0893  hypothetical protein  34.48 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2911  hypothetical protein  34.31 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.215137 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1108  hypothetical protein  34.07 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.843935  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6738  hypothetical protein  34.71 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.396339 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4930  hypothetical protein  27.15 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.325685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3531  hypothetical protein  24.67 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.325005 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3916  hypothetical protein  28.68 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00240375  hitchhiker  0.00943034 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6958  hypothetical protein  33.98 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.141426 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0895  hypothetical protein  27.61 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1279  hypothetical protein  29.46 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6957  hypothetical protein  26.92 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329306  normal  0.232269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0915  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  48.5  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.275213 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0314  hypothetical protein  27.03 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.285622 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4281  hypothetical protein  30.83 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.419018  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2903  hypothetical protein  31.45 
 
 		 145 aa  41.6  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.851598  normal  0.0646646 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0643  hypothetical protein  42.86 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>