18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1409 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1409  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  302  9.000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.523935  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0893  hypothetical protein  62.59 
 
 
147 aa  186  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0895  hypothetical protein  37.68 
 
 
152 aa  100  9e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3531  hypothetical protein  38.36 
 
 
145 aa  94.7  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.325005 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3916  hypothetical protein  30.94 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00240375  hitchhiker  0.00943034 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1928  hypothetical protein  29.2 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.344998  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4930  hypothetical protein  27.21 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.325685  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1108  hypothetical protein  31.4 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.843935  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6738  hypothetical protein  35.56 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.396339 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0314  hypothetical protein  31.82 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.285622 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1279  hypothetical protein  28.48 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0399  hypothetical protein  30.77 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0717  putative lipoprotein  23.88 
 
 
367 aa  45.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.129076 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6958  hypothetical protein  28.87 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.141426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2438  hypothetical protein  22.03 
 
 
155 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84671  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6957  hypothetical protein  23.96 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329306  normal  0.232269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0915  hypothetical protein  21.02 
 
 
207 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.275213 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0640  hypothetical protein  31.15 
 
 
98 aa  40.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>