15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6957 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013732  Slin_6957  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  294  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.329306  normal  0.232269 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6738  hypothetical protein  28.32 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.396339 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6958  hypothetical protein  28.68 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.141426 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3531  hypothetical protein  26.53 
 
 
145 aa  52  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.325005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2438  hypothetical protein  29.85 
 
 
155 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84671  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2911  hypothetical protein  21.14 
 
 
148 aa  51.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.215137 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4930  hypothetical protein  25.17 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.325685  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1928  hypothetical protein  26.32 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.344998  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0895  hypothetical protein  28.57 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2903  hypothetical protein  25.62 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.851598  normal  0.0646646 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0893  hypothetical protein  25.62 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4281  hypothetical protein  25.17 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.419018  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0107  hypothetical protein  27.46 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1409  hypothetical protein  21.93 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.523935  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2368  hypothetical protein  21.74 
 
 
144 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>