31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2345 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2345  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  203  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.0000248352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3351  peptidase  98.04 
 
 		 102 aa  199  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1785  peptidase  89.11 
 
 		 102 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.15986  normal  0.0473515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1945  peptidase  95 
 
 		 102 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053357 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29710  hypothetical protein  60.4 
 
 		 102 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2541  hypothetical protein  60.4 
 
 		 102 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0415354  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3774  peptidase  52.94 
 
 		 102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  56.44 
 
 		 102 aa  124  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1993  peptidase  49.5 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872282  normal  0.14577 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1351  peptidase  47.06 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.207788  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4315  peptidase  50 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3770  peptidase  48.54 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3383  hypothetical protein  40.2 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0287551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3214  peptidase  42.22 
 
 		 106 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1609  hypothetical protein  42.5 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  39.39 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  39.39 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  38.38 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  34.65 
 
 		 101 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  36.17 
 
 		 103 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  31.31 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  40.51 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29720  hypothetical protein  38.3 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2542  hypothetical protein  38.3 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  36.36 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  30.53 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28590  Peptidase M4, thermolysin propeptide  38.75 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1994  peptidase  31.68 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  0.197441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  35.8 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2241  peptidase  40.32 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.043163  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4930  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.325685  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>