45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3213 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  100 
 
 		 102 aa  205  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  88.12 
 
 		 101 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  64 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  68.09 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  64 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  55.45 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  67.5 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  50.52 
 
 		 114 aa  97.4  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28590  Peptidase M4, thermolysin propeptide  67.9 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2542  hypothetical protein  60 
 
 		 100 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29720  hypothetical protein  60 
 
 		 104 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1994  peptidase  54.46 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  0.197441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3774  peptidase  43.16 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29710  hypothetical protein  41.67 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2541  hypothetical protein  41.67 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0415354  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1351  peptidase  38.46 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.207788  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  38.61 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1993  peptidase  35.29 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872282  normal  0.14577 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  42.67 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0313  membrane protein  41.98 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4315  peptidase  34.74 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  40 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5131  hypothetical protein  32.29 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1785  peptidase  29 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.15986  normal  0.0473515 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3764  membrane protein  47.06 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.915458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1945  peptidase  32.5 
 
 		 102 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053357 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2345  hypothetical protein  31.65 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.0000248352 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  33 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3214  peptidase  26.67 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3351  peptidase  30 
 
 		 102 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4486  hypothetical protein  35.37 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  36.59 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1609  hypothetical protein  30.38 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  36.59 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0240  peptidase  35.82 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  35.82 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  35.37 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  35.82 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0240  peptidase  35.82 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  35.82 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3186  hypothetical protein  41.54 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6195  Propeptide PepSY amd peptidase M4  31.37 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  32 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3383  hypothetical protein  26.44 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0287551  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4084  membrane protein  33.33 
 
 		 109 aa  40.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>