34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1351 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1351  peptidase  100 
 
 		 103 aa  207  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.207788  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  57.73 
 
 		 102 aa  121  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3774  peptidase  53.92 
 
 		 102 aa  121  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29710  hypothetical protein  53.47 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2541  hypothetical protein  53.47 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0415354  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1993  peptidase  53 
 
 		 102 aa  110  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872282  normal  0.14577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1785  peptidase  48 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.15986  normal  0.0473515 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2345  hypothetical protein  53.85 
 
 		 102 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.0000248352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3351  peptidase  53.16 
 
 		 102 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1945  peptidase  53.16 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053357 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3770  peptidase  41.58 
 
 		 102 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4315  peptidase  50 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3383  hypothetical protein  42.53 
 
 		 102 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0287551  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1609  hypothetical protein  45.57 
 
 		 102 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3214  peptidase  40.66 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  45.1 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  45.1 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  44.21 
 
 		 101 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  44.12 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  37.76 
 
 		 114 aa  73.6  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28590  Peptidase M4, thermolysin propeptide  53.09 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  38.46 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  46.84 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29720  hypothetical protein  43.75 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  37.65 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2542  hypothetical protein  43.75 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1994  peptidase  43.4 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  0.197441 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  31.73 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  32 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  35.24 
 
 		 104 aa  47.4  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0313  membrane protein  36.14 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1052  peptidase  35.79 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.92611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0908  peptidase  35.79 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5445  hypothetical protein  38.71 
 
 		 138 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0704203  normal  0.135047 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>