30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2541 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_29710  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  207  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266098  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2541  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  207  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0415354  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3774  peptidase  72.28 
 
 
102 aa  156  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390086  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  72.55 
 
 
102 aa  153  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1993  peptidase  61.76 
 
 
102 aa  138  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872282  normal  0.14577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1785  peptidase  61.39 
 
 
102 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.15986  normal  0.0473515 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1351  peptidase  53.47 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.207788  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2345  hypothetical protein  60.4 
 
 
102 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.0000248352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3351  peptidase  59.8 
 
 
102 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1945  peptidase  63.75 
 
 
102 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053357 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3770  peptidase  49.51 
 
 
102 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3383  hypothetical protein  50.98 
 
 
102 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0287551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3214  peptidase  50.98 
 
 
106 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4315  peptidase  49.5 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1609  hypothetical protein  49.37 
 
 
102 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  47.96 
 
 
104 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  47.96 
 
 
104 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  45.92 
 
 
104 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  44.57 
 
 
103 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  41.58 
 
 
101 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  41.67 
 
 
102 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  39.39 
 
 
114 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  50 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1994  peptidase  49.48 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  0.197441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2542  hypothetical protein  44.21 
 
 
100 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28590  Peptidase M4, thermolysin propeptide  50.62 
 
 
106 aa  70.1  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29720  hypothetical protein  44.21 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  39.81 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  39.02 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  36.79 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>