21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3770 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3770  peptidase  100 
 
 		 102 aa  207  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1609  hypothetical protein  76.47 
 
 		 102 aa  134  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2541  hypothetical protein  49.51 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0415354  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29710  hypothetical protein  49.51 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  45.63 
 
 		 102 aa  95.9  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1785  peptidase  46.08 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.15986  normal  0.0473515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3351  peptidase  51.25 
 
 		 102 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1351  peptidase  41.58 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.207788  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3774  peptidase  41.75 
 
 		 102 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2345  hypothetical protein  48.75 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.0000248352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1945  peptidase  48.75 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053357 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1993  peptidase  38.83 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872282  normal  0.14577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4315  peptidase  43.14 
 
 		 101 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3383  hypothetical protein  39.24 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0287551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3214  peptidase  37.5 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  34.41 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  31.63 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  31.63 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  31.63 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1994  peptidase  27.84 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  0.197441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  25.51 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>