29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3383 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3383  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  210  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0287551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3214  peptidase  81.37 
 
 		 106 aa  157  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29710  hypothetical protein  50.98 
 
 		 102 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2541  hypothetical protein  50.98 
 
 		 102 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0415354  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3774  peptidase  51.96 
 
 		 102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1993  peptidase  48.04 
 
 		 102 aa  107  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872282  normal  0.14577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  49.02 
 
 		 102 aa  106  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1785  peptidase  43.56 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.15986  normal  0.0473515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3351  peptidase  41.18 
 
 		 102 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2345  hypothetical protein  40.2 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.0000248352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1945  peptidase  43.75 
 
 		 102 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053357 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1351  peptidase  39.58 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.207788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3770  peptidase  35.92 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1609  hypothetical protein  43.04 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4315  peptidase  36.63 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  32.26 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  32.26 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  32.26 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29720  hypothetical protein  34.74 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  30.43 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2542  hypothetical protein  34.74 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  31.31 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28590  Peptidase M4, thermolysin propeptide  37.04 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  28.71 
 
 		 101 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  32.5 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  33.68 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1994  peptidase  29.41 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  0.197441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  33.82 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  23.53 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>