35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4315 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4315  peptidase  100 
 
 		 101 aa  204  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1785  peptidase  51.49 
 
 		 102 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.15986  normal  0.0473515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2541  hypothetical protein  49.5 
 
 		 102 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0415354  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29710  hypothetical protein  49.5 
 
 		 102 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  47.52 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3774  peptidase  46.08 
 
 		 102 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1351  peptidase  50 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.207788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3770  peptidase  43.14 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1993  peptidase  39.6 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872282  normal  0.14577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2345  hypothetical protein  45.57 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.0000248352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3351  peptidase  46.15 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1945  peptidase  43.04 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  39.39 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1609  hypothetical protein  43.04 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  39.18 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  39.18 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  37.62 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3383  hypothetical protein  38.36 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0287551  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  36.56 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  34.74 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3214  peptidase  38.24 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29720  hypothetical protein  34.95 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2542  hypothetical protein  37.84 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  38.46 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  32.67 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28590  Peptidase M4, thermolysin propeptide  37.84 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1994  peptidase  33.33 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  0.197441 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3764  membrane protein  38.24 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.915458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  26.04 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0908  peptidase  36 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1052  peptidase  36 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.92611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3510  hypothetical protein  32.18 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134478  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3897  peptidase  31.48 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.33427  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0649  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  40.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.212597  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3687  peptidase  34.38 
 
 		 181 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.075913  normal  0.111826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>