13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3897 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3897  peptidase  100 
 
 
105 aa  207  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.33427  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0935  peptidase  50.75 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.088972 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  31.37 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0927  peptidase  37.84 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  36.71 
 
 
105 aa  47.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3061  peptidase  27.45 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3764  membrane protein  35.29 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.915458  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3780  peptidase  38.36 
 
 
248 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0669086  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4315  peptidase  31.48 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4084  membrane protein  32.86 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1884  peptidase  32.84 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3510  hypothetical protein  31.82 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134478  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  32.84 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>