65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1661 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1661  peptidase  100 
 
 		 104 aa  204  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  41.18 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0313  membrane protein  50.75 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4084  membrane protein  41.56 
 
 		 109 aa  67  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  38.16 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3155  hypothetical protein  50.72 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3510  hypothetical protein  50.72 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211688  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3061  peptidase  38.82 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  44.26 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5131  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  41.38 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1884  peptidase  44.93 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4405  peptidase  42.11 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.706489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4933  peptidase  46.03 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  44.93 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5305  Propeptide PepSY amd peptidase M4  46.38 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4695  peptidase  44.62 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6195  Propeptide PepSY amd peptidase M4  42.86 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  43.55 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3897  peptidase  31.37 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.33427  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  40 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0629  hypothetical protein  41.54 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000224973  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3764  membrane protein  41.89 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.915458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3186  hypothetical protein  43.28 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0240  peptidase  34.92 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  33.85 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  33.85 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0240  peptidase  34.92 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  33.85 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  33.85 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  33.85 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1885  hypothetical protein  39.51 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  0.020985 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  35.59 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4596  hypothetical protein  42.03 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  34.62 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  35.24 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1980  hypothetical protein  34.51 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4483  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  33.65 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4115  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.942917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  33.65 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4515  hypothetical protein  43.08 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0560805  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4486  hypothetical protein  32.31 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5574  hypothetical protein  39.06 
 
 		 101 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185184  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1993  peptidase  33.33 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872282  normal  0.14577 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1351  peptidase  35.24 
 
 		 103 aa  47.4  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.207788  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  37.97 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  41.18 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1243  hypothetical protein  38.46 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3687  peptidase  35.48 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.075913  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1476  peptidase  42.55 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000134436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3774  peptidase  35.24 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02657  hypothetical protein  36.92 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2541  hypothetical protein  36.79 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0415354  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003783  membrane protein  36.51 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000349662  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1994  peptidase  31.43 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  0.197441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29710  hypothetical protein  36.79 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3874  hypothetical protein  26.88 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000339506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4806  hypothetical protein  31.43 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325935  normal  0.738091 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1138  hypothetical protein  42.55 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2103  Propeptide PepSY amd peptidase M4  27.94 
 
 		 254 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752082  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3510  hypothetical protein  27.16 
 
 		 102 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134478  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0661  hypothetical protein  29.69 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000789332  hitchhiker  0.000026352 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0927  peptidase  33.85 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0422  propeptide PepSY amd peptidase M4  37.1 
 
 		 173 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>