45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3061 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3061  peptidase  100 
 
 
128 aa  256  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0629  hypothetical protein  47.57 
 
 
113 aa  94.4  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000224973  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5131  hypothetical protein  34.21 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  37.25 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  39.74 
 
 
101 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1980  hypothetical protein  30.47 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  38.82 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1884  peptidase  42.11 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02657  hypothetical protein  36.25 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4084  membrane protein  38.46 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0313  membrane protein  35.8 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5574  hypothetical protein  35.35 
 
 
101 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185184  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  32.29 
 
 
103 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1243  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003783  membrane protein  33.75 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000349662  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1387  hypothetical protein  29.9 
 
 
92 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4483  hypothetical protein  35.42 
 
 
110 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16173  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4115  hypothetical protein  35.42 
 
 
110 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.942917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0240  peptidase  34.18 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  34.18 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  34.18 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0240  peptidase  34.18 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  34.21 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  32.91 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  32.91 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000271334 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  32.91 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  35.29 
 
 
104 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  35.29 
 
 
104 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  36.51 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6195  Propeptide PepSY amd peptidase M4  31.63 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4596  hypothetical protein  35.29 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  35.29 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3897  peptidase  27.45 
 
 
105 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.33427  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4405  peptidase  33.33 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.706489  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4486  hypothetical protein  31.65 
 
 
88 aa  44.3  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3741  hypothetical protein  25.71 
 
 
173 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0280  hypothetical protein  25.71 
 
 
173 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000115662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1885  hypothetical protein  33.8 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  0.020985 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0396  hypothetical protein  25.71 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4933  peptidase  36.07 
 
 
121 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3764  membrane protein  35.38 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.915458  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3780  peptidase  31.03 
 
 
248 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0669086  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0281  hypothetical protein  24.29 
 
 
173 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000237407 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3510  hypothetical protein  35 
 
 
117 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211688  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3155  hypothetical protein  35 
 
 
117 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0526297 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>