37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5574 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5574  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185184  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5305  Propeptide PepSY amd peptidase M4  42.05 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1884  peptidase  50.68 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4405  peptidase  35.54 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.706489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6195  Propeptide PepSY amd peptidase M4  44.09 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4933  peptidase  44.44 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4695  peptidase  44.29 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3061  peptidase  35.35 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  32.99 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4483  hypothetical protein  41.24 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4115  hypothetical protein  41.24 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.942917 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4596  hypothetical protein  47.54 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1885  hypothetical protein  45.71 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  0.020985 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  32.95 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4084  membrane protein  35.14 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  29.67 
 
 		 103 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1387  hypothetical protein  25.77 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  31.58 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  30.86 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  36.11 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  30.86 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5131  hypothetical protein  28.72 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0629  hypothetical protein  32.32 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000224973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0240  peptidase  30.86 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0240  peptidase  29.63 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  30 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  30 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  30 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271334 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0661  hypothetical protein  24.44 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000789332  hitchhiker  0.000026352 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4486  hypothetical protein  28.75 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  32.86 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3510  hypothetical protein  40.3 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211688  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3155  hypothetical protein  40.3 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3510  hypothetical protein  25.81 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134478  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3897  peptidase  31.37 
 
 		 105 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.33427  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3874  hypothetical protein  23.4 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000339506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3780  peptidase  39.44 
 
 		 248 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0669086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>