59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1884 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1884  peptidase  100 
 
 		 104 aa  201  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5305  Propeptide PepSY amd peptidase M4  57.14 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4405  peptidase  43.55 
 
 		 127 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.706489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4933  peptidase  61.97 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4695  peptidase  59.72 
 
 		 107 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5574  hypothetical protein  50.68 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185184  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6195  Propeptide PepSY amd peptidase M4  45.36 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  36 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  44.05 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5131  hypothetical protein  38.71 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  40 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  36.73 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4115  hypothetical protein  46.32 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.942917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4483  hypothetical protein  46.32 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3061  peptidase  38.71 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4084  membrane protein  37.33 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  34.74 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4596  hypothetical protein  46.77 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  36.14 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003783  membrane protein  36.11 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000349662  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1885  hypothetical protein  45.45 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  0.020985 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1243  hypothetical protein  36.23 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3780  peptidase  38.96 
 
 		 248 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0669086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  31.58 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02657  hypothetical protein  32.89 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  29.11 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271334 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3874  hypothetical protein  25.74 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000339506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  29.11 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0313  membrane protein  35.06 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0240  peptidase  30.38 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  29.11 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  30.38 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3510  hypothetical protein  39.51 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211688  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  30.38 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3155  hypothetical protein  39.51 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3293  hypothetical protein  23.53 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196419  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0661  hypothetical protein  26.44 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000789332  hitchhiker  0.000026352 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0240  peptidase  30.38 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  31.4 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1980  hypothetical protein  30.43 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0616  hypothetical protein  25 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000414361  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0617  hypothetical protein  25 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000242002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3413  hypothetical protein  25 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000138823  normal  0.329766 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0623  hypothetical protein  25 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0629  hypothetical protein  30.43 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000224973  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4486  hypothetical protein  27.85 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3897  peptidase  32.84 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.33427  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1993  peptidase  28.57 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872282  normal  0.14577 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3874  hypothetical protein  23.61 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000309341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3510  hypothetical protein  25.68 
 
 		 102 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134478  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3748  hypothetical protein  23.61 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0891426  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0577  hypothetical protein  23.61 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00197884  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  29.25 
 
 		 103 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3245  propeptide, PepSY amd peptidase M4  24.69 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000406601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1994  peptidase  32.08 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  0.197441 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3691  hypothetical protein  23.61 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0651  hypothetical protein  26.56 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000188562  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1351  peptidase  28.87 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.207788  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3005  hypothetical protein  26.97 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000355724  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>