64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5098 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  100 
 
 		 101 aa  202  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  66 
 
 		 105 aa  130  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4084  membrane protein  75.31 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5131  hypothetical protein  41.41 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  39.39 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3061  peptidase  35.64 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0629  hypothetical protein  34.02 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000224973  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0313  membrane protein  38.55 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3155  hypothetical protein  39.13 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3510  hypothetical protein  39.13 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211688  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  36 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3764  membrane protein  41.33 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.915458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1884  peptidase  36 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  36.9 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4596  hypothetical protein  43.94 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0240  peptidase  35.71 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4483  hypothetical protein  37.08 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4115  hypothetical protein  37.08 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.942917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  35.82 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271334 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  35.82 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  38.36 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  32.94 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  32.94 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  35.82 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3186  hypothetical protein  38.81 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4405  peptidase  26.27 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.706489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0240  peptidase  31.76 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  32.1 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003783  membrane protein  36 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000349662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6195  Propeptide PepSY amd peptidase M4  32.26 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1885  hypothetical protein  38.57 
 
 		 107 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  0.020985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  32.98 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02657  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4486  hypothetical protein  34.33 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0800  hypothetical protein  34.41 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0187007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  31.91 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  31.91 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4806  hypothetical protein  31.51 
 
 		 201 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325935  normal  0.738091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4933  peptidase  33.8 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  35.44 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0281  hypothetical protein  31.75 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000237407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5574  hypothetical protein  32 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185184  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1980  hypothetical protein  30.67 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28590  Peptidase M4, thermolysin propeptide  36.59 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4515  hypothetical protein  36.92 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0560805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5305  Propeptide PepSY amd peptidase M4  30.67 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1994  peptidase  29 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  0.197441 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3897  peptidase  29.41 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.33427  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3741  hypothetical protein  28.57 
 
 		 173 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0280  hypothetical protein  28.57 
 
 		 173 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000115662 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3379  peptidase  25.93 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000025517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0283  hypothetical protein  27.66 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4695  peptidase  29.58 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  32.22 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3245  propeptide, PepSY amd peptidase M4  31.34 
 
 		 108 aa  40.4  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000406601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0396  hypothetical protein  30.16 
 
 		 173 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  32 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4393  hypothetical protein  30.43 
 
 		 178 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000355578  hitchhiker  0.0000221943 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0661  hypothetical protein  25.27 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000789332  hitchhiker  0.000026352 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3874  hypothetical protein  23.71 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000339506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  32 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4429  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0584  hypothetical protein  26.47 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00300104  normal  0.454317 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1922  peptidase  42.22 
 
 		 167 aa  40  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193807  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>