45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3773 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  100 
 
 		 103 aa  207  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  62.63 
 
 		 104 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  62.24 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  62.24 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  55.34 
 
 		 101 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  55.45 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  65.82 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29720  hypothetical protein  58.25 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28590  Peptidase M4, thermolysin propeptide  65 
 
 		 106 aa  90.9  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2542  hypothetical protein  58.59 
 
 		 100 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  50 
 
 		 114 aa  90.1  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1994  peptidase  51.43 
 
 		 104 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  0.197441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2541  hypothetical protein  44.57 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0415354  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29710  hypothetical protein  44.57 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  42.71 
 
 		 102 aa  80.1  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3774  peptidase  42.27 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1993  peptidase  40.43 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872282  normal  0.14577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1785  peptidase  36.56 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.15986  normal  0.0473515 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1351  peptidase  37.65 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.207788  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4486  hypothetical protein  41.79 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4315  peptidase  36.56 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2345  hypothetical protein  35.44 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.0000248352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3351  peptidase  35.44 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1945  peptidase  35.44 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053357 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  35.48 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  41.79 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  41.79 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271334 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  40.3 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0240  peptidase  40.3 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  40.3 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0240  peptidase  40.3 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  40.3 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3383  hypothetical protein  29.21 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0287551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3770  peptidase  34.41 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  40.3 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3764  membrane protein  47.62 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.915458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  35.24 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3214  peptidase  27.5 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0313  membrane protein  41.1 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1609  hypothetical protein  32.91 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3186  hypothetical protein  36.92 
 
 		 135 aa  43.5  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0935  peptidase  32.39 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.088972 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4933  peptidase  33.85 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5131  hypothetical protein  30.34 
 
 		 120 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1884  peptidase  31.33 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>