29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3214 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3214  peptidase  100 
 
 		 106 aa  224  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3383  hypothetical protein  81.37 
 
 		 102 aa  156  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0287551  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3774  peptidase  52.94 
 
 		 102 aa  117  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29710  hypothetical protein  50.98 
 
 		 102 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2541  hypothetical protein  50.98 
 
 		 102 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0415354  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1993  peptidase  47.06 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872282  normal  0.14577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  45.1 
 
 		 102 aa  97.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1785  peptidase  44.66 
 
 		 102 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.15986  normal  0.0473515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3351  peptidase  43.14 
 
 		 102 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2345  hypothetical protein  42.16 
 
 		 102 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.0000248352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1945  peptidase  42.5 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053357 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1351  peptidase  37.86 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.207788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3770  peptidase  34.95 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4315  peptidase  38.61 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1609  hypothetical protein  38.75 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2542  hypothetical protein  33.68 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29720  hypothetical protein  33.68 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  31.18 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  31.18 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  31.18 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  30.69 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  30.48 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  28.28 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  26.47 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  31.25 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28590  Peptidase M4, thermolysin propeptide  33.33 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  33.68 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1994  peptidase  28.43 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  0.197441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  32.39 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>