31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1785 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1785  peptidase  100 
 
 		 102 aa  205  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.15986  normal  0.0473515 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2345  hypothetical protein  89.11 
 
 		 102 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.0000248352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3351  peptidase  88.12 
 
 		 102 aa  153  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1945  peptidase  92.41 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2541  hypothetical protein  61.39 
 
 		 102 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0415354  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29710  hypothetical protein  61.39 
 
 		 102 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  57.43 
 
 		 102 aa  127  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3774  peptidase  54.46 
 
 		 102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1993  peptidase  48.51 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872282  normal  0.14577 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1351  peptidase  48 
 
 		 103 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.207788  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4315  peptidase  51.49 
 
 		 101 aa  100  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3383  hypothetical protein  43.56 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0287551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3770  peptidase  46.08 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3214  peptidase  45 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  41.24 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  41.24 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1609  hypothetical protein  42.5 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  39.39 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  36.56 
 
 		 103 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  34 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  41.77 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  31.25 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2542  hypothetical protein  37.5 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29720  hypothetical protein  37.23 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28590  Peptidase M4, thermolysin propeptide  38.75 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  36.08 
 
 		 103 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  29 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1994  peptidase  31.68 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  0.197441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  38.36 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2241  peptidase  37.1 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.043163  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1967  peptidase propeptide/YPEB domain-containing protein  36.49 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0253954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>