53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_29720 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_29720  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  196  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2542  hypothetical protein  99 
 
 		 100 aa  186  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  68.57 
 
 		 104 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  66.67 
 
 		 104 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  66.67 
 
 		 104 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  58.25 
 
 		 103 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  73.75 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  60 
 
 		 102 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  56.31 
 
 		 101 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28590  Peptidase M4, thermolysin propeptide  79.01 
 
 		 106 aa  103  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1994  peptidase  66.3 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  0.197441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  53.12 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  46.24 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29710  hypothetical protein  44.21 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2541  hypothetical protein  44.21 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0415354  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1351  peptidase  43.75 
 
 		 103 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.207788  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3774  peptidase  44.9 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.390086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1993  peptidase  43.27 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872282  normal  0.14577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1785  peptidase  37.23 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.15986  normal  0.0473515 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  43.3 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3764  membrane protein  56.34 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.915458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4315  peptidase  34.95 
 
 		 101 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2345  hypothetical protein  37.97 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.651641  hitchhiker  0.0000248352 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3214  peptidase  33.33 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1945  peptidase  37.5 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053357 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3351  peptidase  36.25 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  36.89 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3383  hypothetical protein  38.27 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0287551  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5131  hypothetical protein  32.71 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4486  hypothetical protein  36.05 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  36.05 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  36.05 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271334 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  34.88 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0240  peptidase  34.09 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0240  peptidase  33.33 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  34.09 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  34.09 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  33.33 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0313  membrane protein  42.47 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  34 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003783  membrane protein  43.28 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000349662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1609  hypothetical protein  30.38 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02657  hypothetical protein  44.78 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0629  hypothetical protein  34.62 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000224973  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3770  peptidase  27.08 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.150501 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  32.1 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  38.36 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4084  membrane protein  36.07 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3019  peptidase  44.44 
 
 		 206 aa  43.5  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1243  hypothetical protein  40.98 
 
 		 135 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3293  hypothetical protein  26.88 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196419  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1980  hypothetical protein  32.88 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3061  peptidase  35.06 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>