55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0313 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0313  membrane protein  100 
 
 
105 aa  211  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  50.75 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  38.37 
 
 
88 aa  67  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  36.05 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0240  peptidase  36.05 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  36.63 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  36.05 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0240  peptidase  34.88 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  36.05 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  36.05 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  36.05 
 
 
88 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000271334 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3061  peptidase  33.66 
 
 
128 aa  61.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  38.1 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  42.86 
 
 
104 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  42.86 
 
 
104 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  40 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  42.86 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4486  hypothetical protein  34.88 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  36.36 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  39.39 
 
 
114 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  42.17 
 
 
102 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  43.59 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6195  Propeptide PepSY amd peptidase M4  30.39 
 
 
103 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0661  hypothetical protein  34.12 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000789332  hitchhiker  0.000026352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  38.37 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3186  hypothetical protein  42.11 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  35.53 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4084  membrane protein  32.43 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3510  hypothetical protein  36 
 
 
102 aa  47.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134478  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5305  Propeptide PepSY amd peptidase M4  38.81 
 
 
112 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4933  peptidase  39.68 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1351  peptidase  33.02 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.207788  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0629  hypothetical protein  33.67 
 
 
113 aa  45.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000224973  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3874  hypothetical protein  26.67 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000339506  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1884  peptidase  35.06 
 
 
104 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3874  hypothetical protein  34.78 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000309341  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3748  hypothetical protein  34.78 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0891426  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0623  hypothetical protein  34.78 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0577  hypothetical protein  34.78 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00197884  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0616  hypothetical protein  34.78 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000414361  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3413  hypothetical protein  34.78 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000138823  normal  0.329766 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0617  hypothetical protein  34.78 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000242002  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3691  hypothetical protein  34.78 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272245  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4695  peptidase  39.06 
 
 
107 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412283  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5131  hypothetical protein  29.81 
 
 
120 aa  43.5  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3005  hypothetical protein  36.23 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000355724  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28590  Peptidase M4, thermolysin propeptide  42.47 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3510  hypothetical protein  35.29 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211688  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0800  hypothetical protein  35 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0187007 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3155  hypothetical protein  35.29 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1993  peptidase  31.25 
 
 
102 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872282  normal  0.14577 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1243  hypothetical protein  39.62 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4405  peptidase  33.33 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.706489  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3293  hypothetical protein  32 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196419  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0651  hypothetical protein  31.88 
 
 
115 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000188562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>