46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0358 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  100 
 
 		 88 aa  175  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0240  peptidase  94.32 
 
 		 88 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  93.18 
 
 		 88 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  92.05 
 
 		 88 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0240  peptidase  92.05 
 
 		 88 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  90.91 
 
 		 88 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  89.77 
 
 		 88 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  89.77 
 
 		 88 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271334 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4486  hypothetical protein  90.91 
 
 		 88 aa  157  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0313  membrane protein  40.48 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4084  membrane protein  39.47 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  33.33 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  36.9 
 
 		 101 aa  53.5  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  38.81 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  40.3 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  37.31 
 
 		 114 aa  50.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  35.59 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3155  hypothetical protein  41.67 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3510  hypothetical protein  41.67 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211688  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3061  peptidase  34.21 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3764  membrane protein  35.82 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.915458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  36.99 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  40.3 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  40.3 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  40.3 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5574  hypothetical protein  35.82 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185184  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4933  peptidase  32.84 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3510  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134478  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  32.22 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  29.41 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3186  hypothetical protein  28.36 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4806  hypothetical protein  29.73 
 
 		 201 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325935  normal  0.738091 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1884  peptidase  31.4 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  35.82 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3005  hypothetical protein  28.75 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000355724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5131  hypothetical protein  26.92 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0584  hypothetical protein  31.34 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00300104  normal  0.454317 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02657  hypothetical protein  30.59 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0661  hypothetical protein  30.65 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000789332  hitchhiker  0.000026352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5305  Propeptide PepSY amd peptidase M4  32.84 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  35.48 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0629  hypothetical protein  30.86 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000224973  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1265  peptidase  37.5 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000241223  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4695  peptidase  26.67 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003783  membrane protein  29.41 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000349662  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1994  peptidase  34.33 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  0.197441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>