18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1265 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1265  peptidase  100 
 
 		 113 aa  233  9e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000241223  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3379  peptidase  45.76 
 
 		 111 aa  88.6  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000025517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3245  propeptide, PepSY amd peptidase M4  44.12 
 
 		 108 aa  86.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000406601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2934  peptidase  45.1 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00671564  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2694  peptidase  47.62 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000037509  normal  0.0940789 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1133  peptidase  52.46 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.034068  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4139  Propeptide PepSY amd peptidase M4  42.48 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0676488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4211  peptidase  41.59 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000802331  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4343  peptidase  41.59 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000216111  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3302  hypothetical protein  44.3 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0283  hypothetical protein  48.44 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4646  hypothetical protein  35.4 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3851  peptidase  39.47 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4024  peptidase  38.26 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3907  peptidase  38.26 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000603836  normal  0.452206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3816  peptidase  38.26 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134174  hitchhiker  0.00511422 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3686  peptidase  31.82 
 
 		 90 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126724  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  37.5 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>