20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3851 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3851  peptidase  100 
 
 		 100 aa  202  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4024  peptidase  84 
 
 		 100 aa  174  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3816  peptidase  84 
 
 		 100 aa  174  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134174  hitchhiker  0.00511422 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3907  peptidase  84 
 
 		 100 aa  174  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000603836  normal  0.452206 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4646  hypothetical protein  84 
 
 		 99 aa  166  9e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4139  Propeptide PepSY amd peptidase M4  81 
 
 		 96 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0676488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4343  peptidase  81 
 
 		 96 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000216111  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4211  peptidase  80 
 
 		 96 aa  160  7e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000802331  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2934  peptidase  55.22 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00671564  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3245  propeptide, PepSY amd peptidase M4  38.89 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000406601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1265  peptidase  39.47 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000241223  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3379  peptidase  40.54 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000025517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1133  peptidase  54.1 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.034068  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3302  hypothetical protein  49.25 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0283  hypothetical protein  35.29 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1387  hypothetical protein  39.06 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2694  peptidase  43.94 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000037509  normal  0.0940789 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0927  peptidase  43.4 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2506  propeptide, PepSY amd peptidase M4  42 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.380637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3686  peptidase  40.74 
 
 		 90 aa  40  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>