20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1133 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1133  peptidase  100 
 
 		 118 aa  234  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.034068  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2934  peptidase  51.38 
 
 		 108 aa  100  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00671564  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3245  propeptide, PepSY amd peptidase M4  55.71 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000406601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3379  peptidase  58.57 
 
 		 111 aa  90.9  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000025517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1265  peptidase  49.35 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000241223  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4646  hypothetical protein  45.79 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2694  peptidase  57.14 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000037509  normal  0.0940789 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3816  peptidase  45.37 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134174  hitchhiker  0.00511422 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3907  peptidase  45.37 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000603836  normal  0.452206 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4024  peptidase  45.37 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4139  Propeptide PepSY amd peptidase M4  46.43 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0676488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4211  peptidase  46.43 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000802331  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4343  peptidase  46.43 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000216111  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3302  hypothetical protein  49.28 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0283  hypothetical protein  42.19 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3851  peptidase  41.67 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3352  hypothetical protein  32.04 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000394447  normal  0.0556359 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4084  membrane protein  36.73 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  38.78 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3686  peptidase  35.19 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>