20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4646 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4646  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  200  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4024  peptidase  92 
 
 		 100 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3816  peptidase  92 
 
 		 100 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134174  hitchhiker  0.00511422 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3907  peptidase  92 
 
 		 100 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000603836  normal  0.452206 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3851  peptidase  84 
 
 		 100 aa  166  9e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4139  Propeptide PepSY amd peptidase M4  82 
 
 		 96 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0676488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4343  peptidase  82 
 
 		 96 aa  155  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000216111  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4211  peptidase  81 
 
 		 96 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000802331  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2934  peptidase  48.15 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00671564  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3379  peptidase  45.05 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000025517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3245  propeptide, PepSY amd peptidase M4  39.81 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000406601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1133  peptidase  60.66 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.034068  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1265  peptidase  35.4 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000241223  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3302  hypothetical protein  50.68 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2694  peptidase  49.23 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000037509  normal  0.0940789 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0283  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1387  hypothetical protein  35.29 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0927  peptidase  45.28 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3352  hypothetical protein  52.08 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000394447  normal  0.0556359 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3686  peptidase  42.59 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>