16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3352 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3352  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  279  9e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000394447  normal  0.0556359 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2934  peptidase  50 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00671564  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3686  peptidase  46.3 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126724  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3302  hypothetical protein  48.98 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3245  propeptide, PepSY amd peptidase M4  43.64 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000406601  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4646  hypothetical protein  52.08 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3816  peptidase  52.08 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134174  hitchhiker  0.00511422 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3907  peptidase  52.08 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000603836  normal  0.452206 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1133  peptidase  42.31 
 
 		 118 aa  42.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.034068  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4024  peptidase  52.08 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4211  peptidase  52.08 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000802331  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4343  peptidase  52.08 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000216111  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3379  peptidase  35.51 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000025517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4139  Propeptide PepSY amd peptidase M4  52.08 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0676488  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1387  hypothetical protein  41.38 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0283  hypothetical protein  44.23 
 
 		 88 aa  40  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>