21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3302 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3302  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  205  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2934  peptidase  47.12 
 
 		 108 aa  92.8  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00671564  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3379  peptidase  41.9 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000025517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3245  propeptide, PepSY amd peptidase M4  52.78 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000406601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1265  peptidase  44.3 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000241223  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2694  peptidase  50.79 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000037509  normal  0.0940789 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4211  peptidase  45 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000802331  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1133  peptidase  50.82 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.034068  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4139  Propeptide PepSY amd peptidase M4  45.36 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0676488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4343  peptidase  44.33 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000216111  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0283  hypothetical protein  38.2 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4024  peptidase  44.12 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3907  peptidase  44.12 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000603836  normal  0.452206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3816  peptidase  44.12 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134174  hitchhiker  0.00511422 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4646  hypothetical protein  50.68 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3851  peptidase  49.25 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1387  hypothetical protein  34.65 
 
 		 92 aa  52.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3686  peptidase  43.64 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126724  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0927  peptidase  48.33 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3352  hypothetical protein  48.98 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000394447  normal  0.0556359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1955  peptidase  47.5 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000710017  normal  0.73852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>