16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2694 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2694  peptidase  100 
 
 		 105 aa  208  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000037509  normal  0.0940789 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2934  peptidase  50 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00671564  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3245  propeptide, PepSY amd peptidase M4  48.6 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000406601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3379  peptidase  47.27 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000025517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1265  peptidase  47.62 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000241223  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1133  peptidase  56.67 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.034068  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3302  hypothetical protein  50.79 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0283  hypothetical protein  42.86 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4139  Propeptide PepSY amd peptidase M4  43.4 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0676488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4211  peptidase  42.45 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000802331  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4343  peptidase  51.52 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000216111  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3816  peptidase  39.42 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134174  hitchhiker  0.00511422 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3907  peptidase  39.42 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000603836  normal  0.452206 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4024  peptidase  39.42 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4646  hypothetical protein  49.23 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3851  peptidase  43.94 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>