19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0283 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0283  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  180  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3245  propeptide, PepSY amd peptidase M4  40.95 
 
 		 108 aa  83.6  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000406601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3379  peptidase  54.24 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000025517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2934  peptidase  48.75 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00671564  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1265  peptidase  48.44 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000241223  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1133  peptidase  46.43 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.034068  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2694  peptidase  42.86 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000037509  normal  0.0940789 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3302  hypothetical protein  38.2 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4343  peptidase  36.73 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000216111  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4139  Propeptide PepSY amd peptidase M4  37.76 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0676488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4211  peptidase  36.73 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000802331  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3851  peptidase  35.29 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4024  peptidase  35.29 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3907  peptidase  35.29 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000603836  normal  0.452206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3816  peptidase  35.29 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134174  hitchhiker  0.00511422 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4646  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0629  hypothetical protein  30.51 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000224973  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4933  peptidase  34.62 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3352  hypothetical protein  44.23 
 
 		 138 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000394447  normal  0.0556359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>