39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4933 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4933  peptidase  100 
 
 		 121 aa  243  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5305  Propeptide PepSY amd peptidase M4  73.56 
 
 		 112 aa  123  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4695  peptidase  78.87 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4405  peptidase  57.52 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.706489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1884  peptidase  61.84 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6195  Propeptide PepSY amd peptidase M4  57.53 
 
 		 103 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5574  hypothetical protein  45.57 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185184  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  44.78 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4084  membrane protein  38.67 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  37.5 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0313  membrane protein  40.58 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  37.88 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  35.06 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4596  hypothetical protein  38.24 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5131  hypothetical protein  32 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4483  hypothetical protein  38.24 
 
 		 110 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4115  hypothetical protein  38.24 
 
 		 110 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.708115  normal  0.942917 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3510  hypothetical protein  42.65 
 
 		 117 aa  48.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211688  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3155  hypothetical protein  42.65 
 
 		 117 aa  48.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  27.97 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  31.71 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0240  peptidase  28.75 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  28.21 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  28.21 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1885  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  0.020985 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  28.21 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  33.33 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  29.23 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0240  peptidase  28.21 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  29.23 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003783  membrane protein  35.85 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000349662  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1980  hypothetical protein  41.51 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1243  hypothetical protein  37.74 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3061  peptidase  36.07 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  31.94 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02657  hypothetical protein  33.96 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0283  hypothetical protein  34.62 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  32 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4486  hypothetical protein  27.63 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>